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Enregistrement W2153883021 · doi:10.1111/j.1462-2920.2005.00780.x

Worldwide distribution of <i>Pseudomonas aeruginosa</i> clone C strains in the aquatic environment and cystic fibrosis patients

2005· article· en· W2153883021 sur OpenAlexaboutno aff
Ute Römling, Abdul Kader, Dinesh Diraviam Sriramulu, Roger Simm, Göran Kronvall

Notice bibliographique

RevueEnvironmental Microbiology · 2005
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBacterial biofilms and quorum sensing
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesKarolinska InstitutetUniversity of Pittsburgh
Mots-clésclone (Java method)BiologyPseudomonas aeruginosaMicrobiologyPlasmidBiofilmColonizationCystic fibrosisPulsed-field gel electrophoresisEcological nicheAntibiotic resistancePhenotypeSerotypeAntibioticsBacteriaGenotypeGeneticsGeneEcologyHabitat

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Highly successful bacterial clones have the ability to effectively colonize environmental niches and patients. However, the factors which determine the complex interplay between the colonization of environmental niches and patients are mainly unknown. In this study we show that Pseudomonas aeruginosa clone C strains are distributed worldwide and highly prone to infect cystic fibrosis (CF) patients in Canada, England, France and Germany. In Hanover, Germany and Vancouver, Canada, clone C strains are highly prevalent in the CF patient community, although the mechanisms of acquisition may have been different. All clone C strains showed highly related macrorestriction fragment pattern of the whole genome as visualized by pulsed-field gel electrophoresis and harboured the 102 kbp plasmid pKLC102. Comparison of three prevalent P. aeruginosa clones with different distribution between the environment and patients revealed that neither enhanced biofilm formation nor antibiotic resistance was responsible for the spread of clone C. Clone M, which was highly prevalent in the clinical environment such as sanitary facilities, lacked motility, which could explain its relatively low prevalence in CF patients. Elucidation of the mechanisms which lead to the prevalence of clone C strain in patients and the environment requires the investigation of additional phenotypes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,384
Score d'incertitude au seuil0,495

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,003
Tête enseignante GPT0,175
Écart entre enseignants0,172 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations86
Publié2005
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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