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Enregistrement W2153940038 · doi:10.1111/j.1365-294x.2011.05390.x

Plant species richness belowground: higher richness and new patterns revealed by next‐generation sequencing

2011· article· en· W2153940038 sur OpenAlexafffund
Inga Hiiesalu, Maarja Öpik, Madis Metsis, Liisa Lilje, John Davison, Martti Vasar, Mari Moora, Martin Zobel, Scott D. Wilson, Meelis Pärtel

Notice bibliographique

RevueMolecular Ecology · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueEcology and Vegetation Dynamics Studies
Établissements canadiensUniversity of Regina
Organismes subventionnairesEuropean Regional Development FundNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaEesti TeadusfondiEuropean Commission
Mots-clésSpecies richnessBody size and species richnessBiologyEcologyPlant communityBiodiversityGrassland

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Variation in plant species richness has been described using only aboveground vegetation. The species richness of roots and rhizomes has never been compared with aboveground richness in natural plant communities. We made direct comparisons of grassland plant richness in identical volumes (0.1 × 0.1 × 0.1 m) above and below the soil surface, using conventional species identification to measure aboveground richness and 454 sequencing of the chloroplast trnL(UAA) intron to measure belowground richness. We described above- and belowground richness at multiple spatial scales (from a neighbourhood scale of centimetres to a community scale of hundreds of metres), and related variation in richness to soil fertility. Tests using reference material indicated that 454 sequencing captured patterns of species composition and abundance with acceptable accuracy. At neighbourhood scales, belowground richness was up to two times greater than aboveground richness. The relationship between above- and belowground richness was significantly different from linear: beyond a certain level of belowground richness, aboveground richness did not increase further. Belowground richness also exceeded that of aboveground at the community scale, indicating that some species are temporarily dormant and absent aboveground. Similar to other grassland studies, aboveground richness declined with increasing soil fertility; in contrast, the number of species found only belowground increased significantly with fertility. These results indicate that conventional aboveground studies of plant richness may overlook many coexisting species, and that belowground richness becomes relatively more important in conditions where aboveground richness decreases. Measuring plant belowground richness can considerably alter perceptions of biodiversity and its responses to natural and anthropogenic factors.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,056
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,047
Tête enseignante GPT0,218
Écart entre enseignants0,171 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations150
Publié2011
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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