Microarray‐based identification of aminopeptidase N target genes in keratinocyte conditioned medium‐stimulated dermal fibroblasts
Notice bibliographique
Résumé
Of the many processes that affect the outcome of wound repair, epidermal-dermal interactions are essential to extracellular matrix (ECM) remodeling and in particular, soluble factors released by keratinocytes are known to have a direct impact on the production of ECM by dermal fibroblasts. Aminopeptidase N (APN) has recently been proposed as a cell-surface receptor for stratifin and is responsible for the stratifin-mediated matrix metalloproteinase-1 (MMP-1) upregulation in fibroblasts. The present study examines whether modulation of APN gene expression has any impact on the fibroblast ECM gene expression profile. The result reveals that in the presence of keratinocyte-derived soluble factors, transient knockdown of APN in dermal fibroblasts affects the expression of key ECM components such as fibronectin, tenascin-C, MMP-1, MMP-3, and MMP-12. The regulatory effects of APN on fibronectin and selective MMPs appear to be associated with receptor-mediated signal transduction independently of its peptidase activity. On the contrary, inhibition of the APN enzymatic activity by bestatin significantly reduces the tenascin-C expression and enhances the contraction of fibroblast-populated collagen gel, suggesting an activity-dependent regulation of fibroblast contractility by APN. The overall effects of APN on the expression of fibronectin, tenascin-C, and MMPs in fibroblasts propose an important role for APN in the regulation of keratinocyte-mediated ECM remodeling and fibroblast contractile activity.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».