Development Of An Aptamer-Based MRI Contrast Agent For Thrombin Detection<sup>1</sup>
Notice bibliographique
Résumé
Thrombin is an enzyme that converts soluble fibrinogen into insoluble strands of fibrin (which works with platelets to form a blood clot). MR imaging of thrombin could be useful in the imaging of blood clots (thrombus and embolus). An MRI contrast agent can be made more specific for a certain protein by conjugating (joining) it to an aptamer. An aptamer is a synthesized single-stranded DNA, targeted (through a process called SELEX) to a specific protein. The development of a targeted MRI contrast agent could enhance the diagnostic value of the obtained MR images. Through screening two series of contrast agents, DOTA (1,4,7,10-tetraazacyclododecane-1,4,7,10-tetraacetic acid) and DTPA (diethylenetriaminepentaacetic acid), this project hopes to find the best system for measuring thrombin in serum. This use of aptamer technology (and DNA synthesis) appears to be a unique method of targeting thrombin rather than the more invasive angiography and angioscopy procedures. The first phase of this project involved the synthesis of aptamer-DOTA and aptamer-DTPA conjugates. Progress towards the development of these conjugates is presented. Upon successful synthesis of the aptamer conjugates, they could be screened to find the best system for measuring thrombin in serum. La thrombine est une enzyme qui convertit le fibrinogène soluble en brins de fibrine insoluble (ce qui permet aux plaquettes de former un caillot de sang). L’imagerie à résonance magnétique (IRM) de la thrombine pourrait être utile pour l’imagerie de caillots sanguins (thrombus et embolie). Un agent de contraste IRM peut être conçu pour viser plus spécifiquement une certaine protéine par voie de conjugaison (liaison) à un aptamère. Un aptamère est simple brin d’ADN synthétisé, qui cible (par le processus SELEX) une protéine spécifique. L’élaboration d’un agent de contraste IRM ciblée envers une protéine particulière pourrait améliorer la valeur diagnostique des images IRM obtenues. Grâce à un dépistage de deux séries d’agents de contrastes, DOTA (acide 1,4,7,10-tétraazacyclododécane-1,4,7,10-tétraacétique) et DTPA (acide diéthylènetriaminepentaacétique), ce projet vise à trouver la meilleure méthode afin de mesurer la thrombine dans le sérum. L’utilisation de cette technologie avec aptamère (et avec la synthèse de l’ADN) semble être une méthode unique afin de cibler la trombine de manière moins invasive que les procédures d’angiographie ou d’angioscopie. La première phase de ce projet consistait de la synthèse du conjugué de l’aptamère DOTA et de l’aptamère DTPA. Le progrès vers l’élaboration de ces conjugués est présenté dans cet article. Dès la réussite de la synthèse des conjugués d’aptamères, ces derniers pourraient être en mesure d’être évalué afin de trouver la meilleure méthode pour mesurer la thrombine dans le sérum.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».