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Enregistrement W2154134481 · doi:10.1073/pnas.0508887103

Differential recognition of plant cell walls by microbial xylan-specific carbohydrate-binding modules

2006· article· en· W2154134481 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueProceedings of the National Academy of Sciences · 2006
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePolysaccharides and Plant Cell Walls
Établissements canadiensUniversity of Victoria
Organismes subventionnairesBiotechnology and Biological Sciences Research Council
Mots-clésXylanCarbohydrate-binding moduleCell wallPolysaccharideBiochemistryGlycoside hydrolaseSecondary cell wallBiologyChemistryHydrolysis

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Glycoside hydrolases that degrade plant cell walls have complex molecular architectures in which one or more catalytic modules are appended to noncatalytic carbohydrate-binding modules (CBMs). CBMs promote binding to polysaccharides and potentiate enzymic hydrolysis. Although there are diverse sequence-based families of xylan-binding CBMs, these modules, in general, recognize both decorated and unsubstituted forms of the target polysaccharide, and thus the evolutionary rationale for this diversity is unclear. Using immunohistochemistry to interrogate the specificity of six xylan-binding CBMs for their target polysaccharides in cell walls has revealed considerable differences in the recognition of plant materials between these protein modules. Family 2b and 15 CBMs bind to xylan in secondary cell walls in a range of dicotyledon species, whereas family 4, 6, and 22 CBMs display a more limited capability to bind to secondary cell walls. A family 35 CBM, which displays more restricted ligand specificity against purified xylans than the other five protein modules, reveals a highly distinctive binding pattern to plant material including the recognition of primary cell walls of certain dicotyledons, a feature shared with CBM15. Differences in the specificity of the CBMs toward walls of wheat grain and maize coleoptiles were also evident. The variation in CBM specificity for ligands located in plant cell walls provides a biological rationale for the repertoire of structurally distinct xylan-binding CBMs present in nature, and points to the utility of these modules in probing the molecular architecture of cell walls.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,017
Score d'incertitude au seuil0,164

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,027
Tête enseignante GPT0,209
Écart entre enseignants0,182 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle