Metabolomic profiling by near-infrared spectroscopy as a tool to assess embryo viability: a novel, non-invasive method for embryo selection
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: The morphology of an embryo has a limited predictive value for assessing viability and ongoing pregnancy, therefore new selection tools are needed to maintain success rates with single-embryo transfer (SET). In this study, we investigated if metabolomic profiling of biomarkers of embryo culture medium by near-infrared (NIR) spectroscopy has a correlation with ongoing pregnancy in SET. METHODS: A total of 333 patients scheduled for in vitro fertilization (IVF) with SET were included in the study. Embryos were selected for transfer by morphological criteria on Days 2 and 3 of in vitro culture, and left over culture media samples were analyzed by NIR spectroscopy. RESULTS: The NIR spectral analysis produced unique metabolomic profiles that correlated to an embryo's reproductive potential. Resulting relative viability scores between positive and negative pregnancy outcomes were statistically significant (P < 0.03). A logistic regression of factors correlated to pregnancy outcomes showed that maternal age, percent fragmentation and relative viability scores all demonstrated a relationship. The extent of the correlation was determined by accuracy computation, where the accuracy of assessing viable embryos on Day 3 by metabolomic profiling was 53.6% and the accuracy of the morphological selection was 38.5%. In addition, the positive predictive value of metabolomic profiling was 0.365 and the negative predictive value was 0.830. CONCLUSIONS: NIR metabolomic profiling of spent embryo culture media was able to distinguish viable embryos from non-viable embryos for reproduction.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».