Imprinting defects in mouse embryos: stochastic errors or polymorphic phenotype?
Notice bibliographique
Résumé
Defects in expression of imprinted genes are believed to cause developmental abnormalities and play a role in carcinogenesis. To determine whether spontaneous imprinting defects may occur in mouse embryos, we studied the expression of two imprinted genes H19 and Igf2 in individual postimplantation 7.5 d.p.c. and 8.5 d.p.c. embryos. Biallelic expression of H19 was found in 1.6% of the embryos, whereas biallelic expression of Igf2 was found in 0.5% of the embryos. The loss of H19 imprinting (LOI) observed in a small fraction of early postimplantation embryos may be purely stochastic. Alternatively, since we never observed it in an inbred background, it may depend on genetic factors acting in trans. Either mechanism could explain the occurrence of polymorphic imprinting as well as the genesis of sporadic imprinting defects, including cancer. The frequency of LOI of H19 was higher than the incidence of sporadic imprinting disorders in humans (about 1 in 20,000). This contradiction may be explained by different incidence of imprinting errors in different imprinted regions of the genome, in different species, or by loss of the majority of nonmosaic embryos with imprinting defects before birth.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».