Analysis of a collagen-binding trimeric autotransporter adhesin from<i>Mannheimia haemolytica</i>A1
Notice bibliographique
Résumé
A locus that codes for a high-molecular-weight adhesin was previously isolated from Mannheimia haemolytica A1. In this study, we showed that this locus, named ahs, codes for two proteins (AhsA and AhsB) that exhibit characteristics of a trimeric autotransporter adhesin. Sequence analysis of AhsA showed the presence of 21 collagen-binding motifs in the protein. Collagen-binding assays showed that M. haemolytica A1 binds to collagen in a dose-dependent manner. This binding activity is trypsin sensitive and can be inhibited by anti-AhsA antibody. AhsB is the cognate transporter for AhsA. The C-terminal of AhsB showed highly conserved amino acids typical of trimeric autotransporters. Experimental data showed that the C-terminal 120 amino acids of AhsB could indeed form trimeric molecules. Western immunoblots showed the presence of anti-AhsA antibodies in the sera of calves that had been challenged with M. haemolytica A1, suggesting that AhsA is expressed and immunogenic in cattle.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».