Genetic Predictors of Circulating 25-Hydroxyvitamin D and Risk of Colorectal Cancer
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: Experimental evidence has demonstrated an antineoplastic role for vitamin D in the colon, and higher circulating 25-hydroxyvitamin D [25(OH)D] levels are consistently associated with a lower risk of colorectal cancer. Genome-wide association studies have identified loci associated with levels of circulating 25(OH)D. The identified single-nucleotide polymorphisms (SNPs) from four gene regions collectively explain approximately 5% of the variance in circulating 25(OH)D. METHODS: We investigated whether five polymorphisms in GC, CYP2R1, CYP24A1, and DHCR7/NADSYN1, genes previously shown to be associated with circulating 25(OH)D levels, were associated with colorectal cancer risk in 10,061 cases and 12,768 controls drawn from 13 studies included in the Genetics and Epidemiology of Colorectal Cancer Consortium (GECCO) and Colon Cancer Family Registry (CCFR). We conducted a meta-analysis of crude and multivariate-adjusted logistic regression models to calculate odds ratios and associated confidence intervals for SNPs individually, SNPs simultaneously, and for a vitamin D additive genetic risk score (GRS). RESULTS: We did not observe a statistically significant association between the 25(OH)D-associated SNPs and colorectal cancer marginally, conditionally, or as a GRS, or for colon or rectal cancer separately. CONCLUSIONS: Our findings do not support an association between SNPs associated with circulating 25(OH)D and risk of colorectal cancer. Additional work is warranted to investigate the complex relationship between 25(OH)D and colorectal cancer risk. IMPACT: There was no association observed between genetic markers of circulating 25(OH)D and colorectal cancer. These genetic markers account for a small proportion of the variance in 25(OH)D.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,003 | 0,010 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,003 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».