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Enregistrement W2154696732 · doi:10.1139/g02-026

LTR retrotransposons in the dioecious plant<i>Silene latifolia</i>

2002· article· en· W2154696732 sur OpenAlexvenueno aff
Sachihiro Matsunaga, Fumi Yagisawa, Maki Yamamoto, Wakana Uchida, Shunsuke Nakao, Shigeyuki Kawano

Notice bibliographique

RevueGenome · 2002
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueChromosomal and Genetic Variations
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésRetrotransposonBiologySileneGenomeGeneticsDioecyEvolutionary biologyBotanyGenePollenTransposable element

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Conserved domains of two types of LTR retrotransposons, Tyl-copia- and Ty3-gypsy-like retrotransposons, were isolated from the dioecious plant Silene latifolia, whose sex is determined by X and Y chromosomes. Southern hybridization analyses using these retrotransposons as probes resulted in identical patterns from male and female genomes. Fluorescence in situ hybridization indicated that these retrotransposons do not accumulate specifically in the sex chromosomes. These results suggest that recombination between the sex chromosomes of S. latifolia has not been severely reduced. Conserved reverse transcriptase regions of Ty1-copia-like retrotransposons were isolated from 13 different Silene species and classified into two major families. Their categorization suggests that parallel divergence of the Ty1-copia-like retrotransposons occurred during the differentiation of Silene species. Most functional retrotransposons from three dioecious species, S. latifolia, S. dioica, and S. diclinis, fell into two clusters. The evolutionary dynamics of retrotransposons implies that, in the genus Silene, dioecious species evolved recently from gynodioecious species.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,935
Score d'incertitude au seuil0,999

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,025
Tête enseignante GPT0,187
Écart entre enseignants0,162 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations33
Publié2002
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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