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Enregistrement W2154795752 · doi:10.1073/pnas.1202216109

Interaction of structure-specific and promiscuous G-protein–coupled receptors mediates small-molecule signaling in <i>Caenorhabditis elegans</i>

2012· article· en· W2154795752 sur OpenAlexafffund
Donha Park, Inish O’Doherty, R.K. Somvanshi, Axel Bethke, Frank C. Schroeder, Ujendra Kumar, Donald L Riddle

Notice bibliographique

RevueProceedings of the National Academy of Sciences · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetics, Aging, and Longevity in Model Organisms
Établissements canadiensCanada's Michael Smith Genome Sciences CentreUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesNational Institute of General Medical SciencesNational Institute on AgingCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésCaenorhabditis elegansReceptorCell biologyBiologySignal transductionComputational biologyGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

A chemically diverse family of small-molecule signals, the ascarosides, control developmental diapause (dauer), olfactory learning, and social behaviors of the nematode model organism, Caenorhabditis elegans. The ascarosides act upstream of conserved signaling pathways, including the insulin, TGF-β, serotonin, and guanylyl cyclase pathways; however, the sensory processes underlying ascaroside function are poorly understood. Because ascarosides often are multifunctional and show strongly synergistic effects, characterization of their receptors will be essential for understanding ascaroside biology and may provide insight into molecular mechanisms that produce synergistic outcomes in small-molecule sensing. Based on DAF-8 immunoprecipitation, we here identify two G-protein-coupled receptors, DAF-37 and DAF-38, which cooperatively mediate ascaroside perception. daf-37 mutants are defective in all responses to ascr#2, one of the most potent dauer-inducing ascarosides, although this mutant responds normally to other ascarosides. In contrast, daf-38 mutants are partially defective in responses to several different ascarosides. Through cell-specific overexpression, we show that DAF-37 regulates dauer when expressed in ASI neurons and adult behavior when expressed in ASK neurons. Using a photoaffinity-labeled ascr#2 probe and amplified luminescence assays (AlphaScreen), we demonstrate that ascr#2 binds to DAF-37. Photobleaching fluorescent energy transfer assays revealed that DAF-37 and DAF-38 form heterodimers, and we show that heterodimerization strongly increases cAMP inhibition in response to ascr#2. These results suggest that that the ascarosides' intricate signaling properties result in part from the interaction of highly structure-specific G-protein-coupled receptors such as DAF-37 with more promiscuous G-protein-coupled receptors such as DAF-38.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,299

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,021
Tête enseignante GPT0,253
Écart entre enseignants0,232 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations119
Publié2012
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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