Amino Acid Residues within Enterohemorrhagic<i>Escherichia coli</i>O157:H7 Tir Involved in Phosphorylation, α-Actinin Recruitment, and Nck-Independent Pedestal Formation
Notice bibliographique
Résumé
Enterohemorrhagic Escherichia coli (EHEC) O157:H7 and enteropathogenic E. coli (EPEC) adherence to epithelial cells results in the formation of actin pedestals. Pedestal formation requires the bacterial protein Tir, which is inserted into the epithelial cell plasma membrane by the type III secretion system. EPEC and EHEC use different Tir-based mechanisms for pedestal formation, and the EPEC Tir residues required have been well described. In contrast, little is known about the regions of EHEC O157:H7 Tir that are essential for pedestal formation. Additionally, EHEC O157:H7 Tir is serine/threonine phosphorylated, although the residues involved and their role in pedestal formation are not known. In this study, we describe two regions within the carboxy terminus of EHEC O157:H7 Tir that are required for phosphorylation and pedestal formation. Serines 436 and 437 are substrates for protein kinase A phosphorylation, although this is not required to form pedestals. Using a series of internal deletion mutants, we found that amino acids 454 to 463 are required for efficient pedestal formation. Deleting this region resulted in a significant decrease in the recruitment of both filamentous actin and the actin binding protein alpha-actinin. As alpha-actinin binds directly to the EHEC O157:H7 amino terminus, these data suggest that its recruitment is dependent on pedestal formation.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».