Structural Effects of a Covalent Linkage Between Antithrombin and Heparin: Covalent N-Terminus Attachment of Heparin Enhances the Maintenance of Antithrombin's Activated State
Notice bibliographique
Résumé
We have produced a molecule comprising of permanently-activated covalently linked antithrombin and heparin (ATH). This study was designed to elucidate the covalent linkage point(s) for heparin on antithrombin and conformational properties of the ATH molecule. ATH was produced using Schiff base/Amadori rearrangement by incubating antithrombin with unfractionated heparin for 14 d at 40 degrees C. ATH was then digested using Proteinase K, and the heparin-peptide was reacted with NaIO4/NaBH4/mild acid to degrade the heparin moiety. Sequencing of the remaining peptide was performed by Edman degradation with linkage point confirmation by LC-MS. The degree of insertion of the reactive center loop (RCL) of antithrombin into the A-sheet of ATH was examined using synthesized antithrombin RCL peptides. Binding between the peptides and ATH, and the formation of ATH in the presence of the peptides were tested. CD was used to further examine the secondary and tertiary structures of ATH. The results suggest that heparin is conjugated to the amino terminal of antithrombin in the majority of ATH molecules, proximal to the previously determined heparin binding domain of antithrombin. From the linkage data, a model is proposed for the structure of ATH. Studies using the RCL peptides and CD analysis of ATH support this model.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».