Naive T Lymphocytes and Recent Thymic Emigrants Are Associated With HIV-1 Disease History in French Adolescents and Young Adults Infected in the Perinatal Period: The ANRS-EP38-IMMIP Study
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: Children born at the start of the human immunodeficiency virus (HIV) epidemic and infected during the perinatal period are now young adults living with the virus. Naive T-lymphocyte restoration is essential for the maintenance of a diverse T-cell receptor repertoire and for immunity to pathogens. METHODS: The ANRS-EP38-IMMIP study included 93 patients infected with HIV type 1 (HIV-1) during the perinatal period. Naive CD4 (CD4N) and CD8 (CD8N) T lymphocytes and CD4 recent thymic emigrants (CD4RTE) were quantified in the peripheral blood by flow cytometry. Wilcoxon tests, Pearson correlation coefficients, and linear regressions were used to study their associations with HIV disease parameters. RESULTS: Median CD4N, CD8N, and CD4RTE percentages were 56% (interquartile range [IQR], 44-64), 31% (IQR, 22-44), and 79% (IQR, 74-83), respectively. The three T-lymphocyte subsets were positively correlated with CD4 T-cell count. Patients aviremic at the time of the study tended to have a lower CD4N percentage (55% vs 58%; P = .10), a significantly higher CD8N percentage (39% vs 22%; P < .0001), and a significantly lower CD4RTE percentage (77% vs 81%; P = .003) than viremic patients. In aviremic patients, CD4N percentages were positively associated with cumulative viremia over the last 10 years (r = 0.335; P = .01) and were significantly higher in patients harboring X4R5 viruses than in those harboring R5 viruses (61% vs 44%; P = .001). CONCLUSIONS: After at least 15 years of HIV infection, perinatally infected youths had preserved CD4N and CD4RTE levels. This persistence of high levels of thymic activity potentially compensating for the deleterious effects of current and past HIV replication is remarkable.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».