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Enregistrement W2155010066 · doi:10.5511/plantbiotechnology.27.47

A high-throughput Agrobacterium tumefaciens-mediated transformation system for molecular breeding and functional genomics of rice (Oryza sativa L.)

2010· article· en· W2155010066 sur OpenAlexaff
Ashok K. Shrawat, Allen G. Good

Notice bibliographique

RevuePlant Biotechnology · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePlant tissue culture and regeneration
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyTransformation (genetics)AgrobacteriumCallusOryza sativaAgrobacterium tumefaciensGenetically modified riceFunctional genomicsGenetically modified cropsRegeneration (biology)Explant cultureTransgeneGeneBotanyGeneticsGenomicsGenomeIn vitro

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Agrobacterium tumefaciens-mediated transformation is the preferred method for genetic transformation of rice. Here we provide a comprehensive and high-through-put protocol for Agrobacterium-mediated transformation of rice for generating the large numbers of transgenic plants that are required for functional analysis and for evaluating traits of agronomic importance. In a project designed to produce nitrogen use efficient rice plants, we refined/improved several factors including optimization of conditions for inducing vir genes prior to transformation, infection and co-cultivation medium for better interaction of target tissues with Agrobacterium. These optimizations supported not only the survival of co-cultured calli in high frequency, but also the production of multiple resistant cell lines per co-cultured embryogenic and nodular callus. In addition, improvements in plant tissue culture, selection and regeneration media has enabled us to produce large numbers of transgenic rice plants containing genes of agronomical importance. Partial desiccation and ABA treatment to hygromycin-resistant callus tissue significantly (P<0.05) enhanced both regeneration frequency and regeneration of transgenic plantlets per callus tissue. Regeneration frequency was further improved by optimizing the concentration of copper sulphate in the regeneration medium. The majority of the transgenic plants obtained using this improved protocol displayed a normal phenotype and the gene of interest was inherited by the progeny in a Mendelian fashion. Homozygous plants of selected lines showed stable phenotypes both in soil and hydroponic conditions even after five generations. Availability of such a high-throughput Agrobacterium-mediated transformation system will improve future opportunities for rice genetics and functional genomics study.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,021
Score d'incertitude au seuil0,458

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,187
Écart entre enseignants0,180 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations5
Publié2010
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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