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Enregistrement W2155131570 · doi:10.1111/jlme.12151

The Challenge of Informed Consent and Return of Results in Translational Genomics: Empirical Analysis and Recommendations

2014· article· en· W2155131570 sur OpenAlexaff
Gail E. Henderson, Susan M. Wolf, Kristine J. Kuczynski, Steven Joffe, Richard R. Sharp, D. Williams Parsons, Bartha Maria Knoppers, Joon‐Ho Yu, Paul S. Appelbaum

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Law Medicine & Ethics · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueEthics in Clinical Research
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesNational Cancer InstituteNational Human Genome Research Institute
Mots-clésInformed consentExomeExome sequencingGenomicsData sharingMEDLINEMedicineGenomeAlternative medicineBiologyGeneticsPathologyGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Large-scale sequencing tests, including whole-exome and whole-genome sequencing (WES/WGS), are rapidly moving into clinical use. Sequencing is already being used clinically to identify therapeutic opportunities for cancer patients who have run out of conventional treatment options, to help diagnose children with puzzling neurodevelopmental conditions, and to clarify appropriate drug choices and dosing in individuals. To evaluate and support clinical applications of these technologies, the National Human Genome Research Institute (NHGRI) and National Cancer Institute (NCI) have funded studies on clinical and research sequencing under the Clinical Sequencing Exploratory Research (CSER) program as well as studies on return of results (RoR). Most of these studies use sequencing in real-world clinical settings and collect data on both the application of sequencing and the impact of receiving genomic findings on study participants. They are occurring in the context of controversy over how to obtain consent for exome and genome sequencing.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,697
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,841
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche, Intégrité de la recherche
Catégories consensuellesMétarecherche
DomaineSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,969
Score d'incertitude au seuil0,373

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,6970,841
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,002
Méta-épidémiologie (sens large)0,0040,002
Bibliométrie0,0040,005
Études des sciences et des technologies0,0110,073
Communication savante0,0220,066
Science ouverte0,0110,016
Intégrité de la recherche0,0310,041
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0090,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,559
Tête enseignante GPT0,590
Écart entre enseignants0,032 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; l’étiquette directe de Gemma et le classifieur distillé Codex s’accordent sur ce qui est montré ici.

Devis d'étudeObservationnel
DomaineMéthodes
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations69
Publié2014
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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