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Enregistrement W2155136807

Transactivation and transrepression in the repression of inflammatory gene expression by dexamethasone

2012· article· en· W2155136807 sur OpenAlexaff
Elizabeth King, Joanna E. Chivers, Mark A. Giembycz, Robert Newton

Notice bibliographique

Revuenon disponible
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCytokine Signaling Pathways and Interactions
Établissements canadiensUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésTransrepressionPsychological repressionTransactivationGlucocorticoid receptorGeneGene expressionBiologyRegulation of gene expressionMolecular biologyCancer researchMedicineGenetics
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: The anti-inflammatory activities of glucocorticoids are attributed to the repression of inflammatory gene expression. Dogma states that this occurs via direct repression (transrepression) by the glucocorticoid receptor (GR) of transcription factors, such as NF-κB. However, evidence also suggests that gene induction (transactivation) by GR is important for repression. AIMS: To assess the roles of transrepression and transactivation in the repression of inflammatory gene expression by dexamethasone (Dex). METHODS AND RESULTS: The effect of Dex on 39 IL-1β-induced genes was examined in human pulmonary A549 cells by real-time PCR. Dex showed a range of activity in terms of the extent (E max ) and potency (EC 50 ) of repression on these genes. These parameters correlated, such that the most highly repressed genes were also the most potently repressed. While all 39 genes were NF-κB-dependent, this did not correlate with repression by Dex. Finally, inhibition of protein translation by cycloheximide (CHX) reduced IL-1β-induced expression of 19 genes (secondary response genes). Of the remaining 21 genes, CHX significantly prevented the Dex-dependent repression of 11 (∼50%), suggesting a role for transactivation. These 11 genes were significantly more sensitive (E max and EC 50 ) to repression by dexamethasone when compared to genes showing repression that was insensitive to CHX (and which may represent a classical transrepression mechanism). CONCLUSIONS: Repression of inflammatory gene expression by dexamethasone involves multiple mechanisms. Transactivation appears to play a significant role showing both high potency and high level of repression on target genes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,014
Score d'incertitude au seuil0,197

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,021
Tête enseignante GPT0,280
Écart entre enseignants0,259 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2012
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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