Microbial Diversity and Biogeochemistry of a Shallow Pristine Canadian Shield Groundwater System
Notice bibliographique
Résumé
An investigation was conducted to assess the microbial diversity and biogeochemistry of a pristine shallow glaciofluvial groundwater system on the Canadian Shield. Vadose zone sands were very fine-grained, consisting mostly of iron oxide-coated quartz. Below the water table in the saturated zone, iron oxide-coating on quartz grains were absent, owing presumably to reductive dissolution by Fe(III)-reducing bacteria and chemical weathering, respectively. Groundwater pH was circumneutral at 6.4 + 0.1, and Eh was slightly reducing at 349 ± 15 mV compared to local surface waters at 417 ± 21 mV; the total dissolved solids concentration in groundwater was 45.2 ± 6.9 mg/L. A total of 269 clones were sequenced and compiled into a 16S rRNA gene library, and representative operational taxonomic units (OTU) were retrieved from basic local alignment search tool (BLAST) analyses at the species-level across 7 phyla, including Acidobacteria, Actinobacteria, Bacteroidetes, Chlorobi, Firmicutes, Planctomycetes, and Proteobacteria. Aerobic, anaerobic, and facultative anaerobic heterotrophs were predominant among the OTU. Lithoautotrophic ammonium- and nitrite-oxidizers were especially prominent, as were diazotrophs, nitrate- and nitrite-reducers. Representative OTU also included Fe(II)-oxidizers and Fe(III)-reducers, whereas those associated with sulfur cycling were rare. These observations suggest that there is considerable potential for biogeochemical cycling of nitrogen and iron within shallow glaciofluvial groundwater systems on the Canadian Shield.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,003 |
| Études des sciences et des technologies | 0,002 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».