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Enregistrement W2155158681 · doi:10.1080/01490451.2011.654378

Microbial Diversity and Biogeochemistry of a Shallow Pristine Canadian Shield Groundwater System

2012· article· en· W2155158681 sur OpenAlexaffabout
V. Shirokova, F. G. Ferris

Notice bibliographique

RevueGeomicrobiology Journal · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueMethane Hydrates and Related Phenomena
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiogeochemistryEnvironmental chemistryFirmicutesPhotic zoneAcidobacteriaProteobacteriaBiogeochemical cycleGroundwaterEnvironmental scienceGeologyEcologyChemistryBiologyNutrientPaleontology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

An investigation was conducted to assess the microbial diversity and biogeochemistry of a pristine shallow glaciofluvial groundwater system on the Canadian Shield. Vadose zone sands were very fine-grained, consisting mostly of iron oxide-coated quartz. Below the water table in the saturated zone, iron oxide-coating on quartz grains were absent, owing presumably to reductive dissolution by Fe(III)-reducing bacteria and chemical weathering, respectively. Groundwater pH was circumneutral at 6.4 + 0.1, and Eh was slightly reducing at 349 ± 15 mV compared to local surface waters at 417 ± 21 mV; the total dissolved solids concentration in groundwater was 45.2 ± 6.9 mg/L. A total of 269 clones were sequenced and compiled into a 16S rRNA gene library, and representative operational taxonomic units (OTU) were retrieved from basic local alignment search tool (BLAST) analyses at the species-level across 7 phyla, including Acidobacteria, Actinobacteria, Bacteroidetes, Chlorobi, Firmicutes, Planctomycetes, and Proteobacteria. Aerobic, anaerobic, and facultative anaerobic heterotrophs were predominant among the OTU. Lithoautotrophic ammonium- and nitrite-oxidizers were especially prominent, as were diazotrophs, nitrate- and nitrite-reducers. Representative OTU also included Fe(II)-oxidizers and Fe(III)-reducers, whereas those associated with sulfur cycling were rare. These observations suggest that there is considerable potential for biogeochemical cycling of nitrogen and iron within shallow glaciofluvial groundwater systems on the Canadian Shield.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,080
Score d'incertitude au seuil0,162

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0020,003
Études des sciences et des technologies0,0020,001
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,175
Écart entre enseignants0,167 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations21
Publié2012
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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