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Enregistrement W2155161651 · doi:10.1093/neuonc/nov061.142

SG-04 * THE eEF2 KINASE, A MEDIATOR OF MEDULLOBLASTOMA ADAPTATION TO METABOLIC STRESS, SUPPORTS FATTY ACID OXIDATION

2015· article· en· W2155161651 sur OpenAlexaff
Gabriel Leprivier, Raffaele Teperino, Anders Kristensen, Marc Remke, Stefan M. Pfister, Michael D. Taylor, J. Andrew Pospisilik, Poul H. Sorensen

Notice bibliographique

RevueNeuro-Oncology · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCancer, Lipids, and Metabolism
Établissements canadiensOccupational Cancer Research CentreUniversity of TorontoUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMediatorAdaptation (eye)Beta oxidationMetabolic adaptationKinaseFatty acidChemistryBiochemistryCell biologyBiologyMetabolismNeuroscience

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

During tumour progression, brain tumour cells are exposed to nutrient deprivation due to defective tumour vasculature. The ability of brain tumour cells to adapt to reduced nutrient availability favours selection for aggressive clones. The molecular pathways supporting such metabolic adaptation are still poorly defined. We previously reported that the translation elongation factor 2 kinase (eEF2K), which controls mRNA translation at the step of elongation, is an evolutionarily conserved mediator of the response to nutrient deprivation. Gene expression analysis show that eEF2K expression is upregulated in the most aggressive subgroup of medulloblastoma (MB), namely group 3, and that high eEF2K expression is strongly associated with poor survival in both MB. In addition, genetic targeting of eEF2K significantly increases sensitivity of MB cells to nutrient deprivation, supporting a role for eEF2K in facilitating adaptation of MB to nutrient stress. To decipher the basis for eEF2K protective functions under nutrient deprivation, we performed gene expression analysis of eEF2K proficient versus deficient cells under nutrient-deprived conditions. Gene set enrichment analysis (GSEA) highlighted fatty acid oxidation (FAO) as one of the biological pathways most dramatically deregulated upon eEF2K loss. Remarkably, many genes involved in FAO are downregulated in eEF2K deficient cells under starvation, including genes encoding acyl-coA synthetases and acyl-coA dehydrogenases. Furthermore, cells lacking eEF2K are deficient in metabolizing exogenous palmitate to produce ATP, strongly supporting a role for eEF2K in stimulating FAO activity. Finally, our data show that pharmacological induction of FAO in eEF2K deficient cells using bezafibrate was sufficient to rescue cell death occurring under nutrient depleted conditions. The molecular basis for eEF2K-mediated regulation of the FAO transcriptional program is under investigation. Together, our work supports a critical role for eEF2K in driving FAO activity under nutrient deprivation, which could profoundly impact medulloblastoma adaptation to nutrient stress and therefore emergence of aggressive phenotypes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,274
Écart entre enseignants0,257 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2015
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Résumé présentoui

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