Mapping and functional characterization of the murine Smoothelin-like 1 promoter
Pourquoi ce travail est dans la base
Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: Smoothelin-like 1 (SMTNL1, also known as CHASM) plays a role in promoting relaxation as well as adaptive responses to exercise, pregnancy and sexual development in smooth and skeletal muscle. Investigations of Smtnl1 transcriptional regulation are still lacking. Thus, in this study, we identify and characterize key regulatory elements of the mouse Smtnl1 gene. RESULTS: We mapped the key regulatory elements of the Smtnl1 promoter region: the transcriptional start site (TSS) lays -44 bp from the translational start codon and a TATA-box motif at -75 bp was conserved amongst all mammalian Smtnl1 promoters investigated. The Smtnl1 proximal promoter enhances expression up to 8-fold in smooth muscle cells and a second activating region lays 500 bp further upstream. Two repressing motifs were present (-118 to -218 bp and -1637 to -1869 bp). The proximal promoter is highly conserved in mammals and contains a mirror repeat sequence. In silico analysis suggests many transcription factors (notably MyoD) could potentially bind within the Smtnl1 proximal promoter sequence. CONCLUSION: Smtnl1 transcript was identified in all smooth muscle tissues examined to date, albeit at much lower levels than found in skeletal muscle. It is unlikely that multiple SMTNL1 isoforms exist since a single Smtnl1 transcription start site was identified in both skeletal and intestinal smooth muscle. Promoter studies suggest restrictive control of Smtnl1 expression in non-muscle cells.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle