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Enregistrement W2155211424 · doi:10.1677/jme-08-0083

Newly-identified receptors for peptide histidine-isoleucine and GHRH-like peptide in zebrafish help to elucidate the mammalian secretin superfamily

2008· article· en· W2155211424 sur OpenAlexafffund
Sheng Wu, Graeme J. Roch, Laura Cervini, Jean Rivier, Nancy M. Sherwood

Notice bibliographique

RevueJournal of Molecular Endocrinology · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueNeuropeptides and Animal Physiology
Établissements canadiensUniversity of Victoria
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésZebrafishSecretinSUPERFAMILYPeptideHistidineSecretin familyReceptorBiologyBiochemistryComputational biologyChemistryAmino acidNeuropeptidePancreasGeneVasoactive intestinal peptide

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

A group of ten hormones in humans are structurally related and known as the secretin superfamily. These hormones bind to G-protein-coupled receptors that activate the cAMP pathway and are clustered as the secretin or B family. We used an evolutionary approach with zebrafish as a model to understand why some of these hormones, such as peptide histidine-methionine (PHM) and pituitary adenylate cyclase-activating polypeptide (PACAP)-related peptide (PRP) in humans lack a receptor. We used molecular techniques to clone two full-length receptor cDNAs in zebrafish, which were analyzed for amino acid sequence and ligand-binding motifs, phylogenetic position, synteny, tissue expression, functional response, and signaling pathway. Evidence is provided that the two cDNAs encoded the peptide histidine-isoleucine (PHI) receptor and PRP receptor, which is known as GHRH-like peptide (GHRH-LP) receptor in non-mammals. Further, we cloned a zebrafish cDNA encoding the peptides PHI and vasoactive intestinal peptide (VIP). The PHIR had been previously labeled as one type of a VIP-PACAP (VPAC2R) shared receptor based only on sequence data. The PHIR cDNA, transfected into COS7 cells, responded to zebrafish PHI in a sensitive and dose-dependent manner (EC(50)=1.8x10(-9) M) but not to PACAP and VIP. The GHRH-LP receptor responded to both zebrafish GHRH-LP1 and GHRH with a 3.5-fold greater response to the former. For comparison, two zebrafish receptors (PAC1R and VPAC1R) and two human receptors (VPAC2R and GHRHR) were tested with human and/or zebrafish peptides. Unexpectedly, zebrafish VIP activated its PAC1R suggesting that in evolution, PAC1R is not always a specific receptor for PACAP. We conclude that zebrafish, like goldfish, have a specific receptor for PHI and GHRH-LP. Our evidence that zebrafish PHI is more potent than human PHM in activating the human VPAC2R (EC(50)=7.4x10(-9) M) supports our suggestion that the VPAC2R and PHIR shared a common ancestral receptor.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,201
Score d'incertitude au seuil0,946

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,030
Tête enseignante GPT0,259
Écart entre enseignants0,230 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations24
Publié2008
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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