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Enregistrement W2155216204 · doi:10.1111/j.1365-294x.2011.05411.x

Speciation in the <i>Rana chensinensis</i> species complex and its relationship to the uplift of the Qinghai–Tibetan Plateau

2012· article· en· W2155216204 sur OpenAlexaff
Wei‐Wei Zhou, Yang Wen, Jinzhong Fu, Yong-Biao Xu, Jie-Qiong Jin, Li Ding, MI‐SOOK MIN, Jing Che, Ya‐Ping Zhang

Notice bibliographique

RevueMolecular Ecology · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic diversity and population structure
Établissements canadiensUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesHong Kong Institute of Education
Mots-clésBiologyGenetic algorithmPlateau (mathematics)Evolutionary biologyEcologyZoology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Speciation remains a fundamental issue in biology. Herein, we report an investigation into speciation in the Rana chensinensis species complex using DNA sequence data from one mitochondrial and five nuclear genes. A phylogenetic analysis of the data revealed four major clades in the complex, and each of them was found to likely represent a species, including one cryptic species. Ecological niche models were generated from 19 climatic variables for three of the four major clades, which were represented by widespread sampling, including R. chensinensis, Rana kukunoris and the potential cryptic species. Each clade is associated with a unique ecological unit, and this indicates that ecological divergence probably drove speciation. Ecological divergence is likely related to the late Cenozoic orogenesis of the Qinghai-Tibetan Plateau. In addition, gene flow between species was detected but only in peripheral portions of the ranges of the four major clades, thus likely had little influence on the speciation processes. Discordances between mitochondrial and nuclear genes were also found; the nominal species, R. chensinensis, contains multiple maternal clades, suggesting potential mitochondrial introgression between R. chensinensis and R. kukunoris.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,194
Score d'incertitude au seuil0,227

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,025
Tête enseignante GPT0,236
Écart entre enseignants0,211 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations93
Publié2012
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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