MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2155227017 · doi:10.4319/lo.2013.58.2.0465

To kill or not to kill: The balance between lytic and lysogenic viral infection is driven by trophic status

2013· article· en· W2155227017 sur OpenAlexafffundabout
Jérôme P. Payet, Curtis A. Suttle

Notice bibliographique

RevueLimnology and Oceanography · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueBacteriophages and microbial interactions
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésLysogenic cycleLytic cycleBiologyBacteriaMarine bacteriophageEcologyMicrobiologyVirusBacteriophageVirologyBiochemistryEscherichia coli

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Experiments were conducted to investigate spatiotemporal patterns in lytic and lysogenic viral infection using water samples collected on the Canadian Arctic Shelf, southern Beaufort Sea. Viral production (VP) and viral‐induced mortality of bacteria (VMB) were determined using a viral reduction approach during a full seasonal cycle, while the percentage of lysogenic bacteria (PLB) in spring and summer was determined in virus‐reduced samples by induction with mitomycin C. Overall, VP (range: 0.3 × 10 8 ‐77 × 10 8 viruses L −1 d −1 ), VMB (range: 0.2 × 10 7 ‐43 × 10 7 bacteria L −1 d −1 ), and PLB (range: 4–38%) displayed marked spatiotemporal variations concomitant with changes in chlorophyll a , bacterial abundance, and production. Highest VP and VMB occurred in summer when the water was warmest, stratified, and most productive, and when viruses removed up to 29% of bacterial standing stock d −1 and released up to 4.3 µg of organic carbon L −1 d −1 . In contrast, the highest PLB occurred in spring when the water was colder, well mixed, and oligotrophic. Correlative and regression analyses indicated viral lytic and lysogenic variables were significantly coupled with chlorophyll a and the abundance, production, and growth rate of bacteria, implying that viral lytic and lysogenic lifestyles were dependent on system productivity. Furthermore, lytic VP and the proportion of lysogenized bacteria were inversely related, suggesting a dynamic interplay between viral infection pathways. Lytic infection was more pronounced when system productivity was high, while lysogeny prevailed when system productivity was low. These data demonstrate the important role of viruses in bacterial mortality and carbon cycling in the Arctic Ocean, and show how their effect is influenced by trophic status.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,161
Score d'incertitude au seuil0,753

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,233
Écart entre enseignants0,226 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations160
Publié2013
Routes d'admission3
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueLimnology and OceanographyMême sujetBacteriophages and microbial interactionsTravaux en français237 207