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Enregistrement W2155376127 · doi:10.5539/jas.v3n4p77

Inter Simple Sequence Repeat Fingerprints for Assess Genetic Diversity of Tunisian Garlic Populations

2011· article· en· W2155376127 sur OpenAlexvenueno aff
Naouel Jabbes, Emmanuel Geoffriau, Valérie Le Clerc, Boutheina Dridi, Cherif Hannechi

Notice bibliographique

RevueJournal of Agricultural Science · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueGarlic and Onion Studies
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésAllium sativumGenetic diversityBiologyGermplasmSubspeciesBoltingGenetic variationMicrosatelliteBotanyGenetic markerGeneticsPopulationZoologyAlleleGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Garlic (Allium sativum L.) that is cultivated in Tunisia is heterogeneous and unclassified with no registered local cultivars. At present, the level of genetic diversity in Tunisian garlic is almost unknown. Inter Simple Sequence Repeats (ISSR) genetic markers were therefore used to assess the genetic diversity and its distribution in 31 Tunisian garlic accessions with 4 French classified clones used as control. It was the first time that ISSR markers were used to detect diversity in garlic. Seventeen ISSR primers were screened; seven primers detected 73 polymorphic bands. A high level of polymorphic loci (p) was found in Tunisian populations (54%). Nei’s total genetic diversity coefficient was 0.45 and 0.34 respectively for Tunisian and French garlic. Genetic distances observed between Tunisian accessions, ranged between 38.4 and 78.1%. Factor analysis of distances’ table (AFTD) did not classify accessions on the base of geographical origin or morpho-physiological characters, particularly bolting ability, but confirmed the appurtenance of analyzed accessions to sativum botanical subspecies. There was sufficient diversity detected to start a national collection of garlic germplasm which is crucial for the conservation of genetic diversity and its valorization. Keywords: Allium sativum L., ISSR markers, genetic diversity, Tunisian garlic populations.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0020,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,177
Tête enseignante GPT0,295
Écart entre enseignants0,118 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations33
Publié2011
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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