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Enregistrement W2155381516 · doi:10.1038/bjc.2011.323

Is there a genetic cause for cancer cachexia? – a clinical validation study in 1797 patients

2011· article· en· W2155381516 sur OpenAlexaff
Tora S. Solheim, Peter Fayers, Torill Fladvad, Ben Tan, Frank Skorpen, Kenneth C.H. Fearon, Vickie E. Baracos, Pål Klepstad, Florian Strasser, S. Kaasa

Notice bibliographique

RevueBritish Journal of Cancer · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueNutrition and Health in Aging
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCachexiaSingle-nucleotide polymorphismMedicineCancer cachexiaCancerInternal medicineBioinformaticsBiologyGeneGeneticsGenotype

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Cachexia has major impact on cancer patients' morbidity and mortality. Future development of cachexia treatment needs methods for early identification of patients at risk. The aim of the study was to validate nine single-nucleotide polymorphisms (SNPs) previously associated with cachexia, and to explore 182 other candidate SNPs with the potential to be involved in the pathophysiology. METHOD: A total of 1797 cancer patients, classified as either having severe cachexia, mild cachexia or no cachexia, were genotyped. RESULTS: After allowing for multiple testing, there was no statistically significant association between any of the SNPs analysed and the cachexia groups. However, consistent with prior reports, two SNPs from the acylpeptide hydrolase (APEH) gene showed suggestive statistical significance (P=0.02; OR, 0.78). CONCLUSION: This study failed to detect any significant association between any of the SNPs analysed and cachexia; although two SNPs from the APEH gene had a trend towards significance. The APEH gene encodes the enzyme APEH, postulated to be important in the endpoint of the ubiquitin system and thus the breakdown of proteins into free amino acids. In cachexia, there is an extensive breakdown of muscle proteins and an increase in the production of acute phase proteins in the liver.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,004
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,004
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,208
Tête enseignante GPT0,469
Écart entre enseignants0,261 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations13
Publié2011
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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