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Enregistrement W2155487600 · doi:10.1074/jbc.275.19.14281

Characterization of a Novel Sphingosine 1-Phosphate Receptor, Edg-8

2000· article· en· W2155487600 sur OpenAlexaff
Dong‐Soon Im, Christopher E. Heise, Nicolas Ancellin, Brian F. O’Dowd, Gan-Ju Shei, R.P. Heavens, Michael R. Rigby, Timothy Hla, Suzanne Mandala, George McAllister, Susan R. George, Kevin R. Lynch

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2000
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueSphingolipid Metabolism and Signaling
Établissements canadiensUniversity of TorontoCentre for Addiction and Mental Health
Organismes subventionnairesNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney DiseasesNational Institute of General Medical Sciences
Mots-clésSphingosineBiologyMolecular biologySphingosine-1-phosphateSphingosine kinaseHEK 293 cellsTransfectionSphingosine-1-phosphate receptorG proteinReceptorBiochemistryGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Three G protein-coupled receptors (Edg-1, Edg-3, and Edg-5) for the lysolipid phosphoric acid mediator sphingosine 1-phosphate have been described by molecular cloning. Using a similar sequence that we found in the expressed sequence tag data base, we cloned and characterized of a fourth, high affinity, rat brain sphingosine 1-phosphate receptor, Edg-8. When HEK293T cells were co-transfected with Edg-8 and G protein DNAs, prepared membranes showed sphingosine 1- phosphate-dependent increases in [(35)S]guanosine 5'-(3-O-thio)triphosphate binding with an EC(50) of 90 nm. In a rat hepatoma Rh7777 cell line that exhibits modest endogenous responses to sphingosine 1-phosphate, this lipid mediator inhibited forskolin-driven rises in cAMP by greater than 90% when the cells were transfected with Edg-8 DNA (IC(50) 0.7 nm). This response is blocked fully by prior treatment of cultures with pertussis toxin, thus implicating signaling through G(i/o)alpha proteins. Furthermore, Xenopus oocytes exhibit a calcium response to sphingosine 1-phosphate after injection of Edg-8 mRNA, but only when oocytes are co-injected with chimeric G(q/i)alpha protein mRNA. Membranes from HEK293T and Rh7777 cell cultures expressing Edg-8 exhibited high affinity (K(D) = 2 nm) binding for radiolabeled sphingosine 1-phosphate. Rat Edg-8 RNA is expressed in spleen and throughout adult rat brain where in situ hybridization revealed it to be associated with white matter. Together our data demonstrate that Edg-8 is a high affinity sphingosine 1-phosphate receptor that couples to G(i/o)alpha proteins and is expressed predominantly by oligodendrocytes and/or fibrous astrocytes in the rat brain.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,237
Écart entre enseignants0,221 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations325
Publié2000
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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