A new <i>SEMA7A</i> variant found in Native Americans with alloantibody
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND AND OBJECTIVES: John Milton Hagen (JMH) antigens are carried by Semaphorin 7A that plays important roles in the nervous system and the immune responses. Its role on the erythrocytes is unclear. Over the years, few samples were referred to our Immunohaematology Reference Laboratory to elucidate their JMH status. MATERIALS AND METHODS: Seven blood samples with antibodies compatible with JMH1-negative red cells were studied at the molecular level to identify polymorphisms and explain the JMH diversity observed. Four samples were of Native American background and three were Caucasians. Molecular analyses of the SEMA7A were undertaken, and soluble form of recombinant Sema7A proteins was produced to characterize the antibodies. RESULTS: Sequencing of the cDNA showed a polymorphism in SEMA7A exon 9 at position 1040 (G>T) in the four Native American samples. Caucasians had a normal sequence. This polymorphism precludes a change at position 347 where an Arg is replaced by a Leu. Plasma was assayed in ELISA on wild-type Sema7AArg347 and variant Sema7ALeu347 proteins. Results clearly indicated a specific recognition of the antibody produced by the Native Americans for the wild-type Sema7AArg347 protein and not the variant one. CONCLUSION: A new SEMA7A variant was identified in this study. The antibody present in the Native American plasma samples should be considered as an alloantibody because it recognizes the wild-type protein.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».