Defective Replication in Human Immunodeficiency Virus Type 1 When Non-\batchmode \documentclass[fleqn,10pt,legalpaper]{article} \usepackage{amssymb} \usepackage{amsfonts} \usepackage{amsmath} \pagestyle{empty} \begin{document} \(\mathrm{tRNA}_{3}^{\mathrm{Lys}}\) \end{document}Primers Are Used for Reverse Transcription
Notice bibliographique
Résumé
ABSTRACT \batchmode \documentclass[fleqn,10pt,legalpaper]{article} \usepackage{amssymb} \usepackage{amsfonts} \usepackage{amsmath} \pagestyle{empty} \begin{document} \(tRNA_{3}^{Lys}\) \end{document} , the primer for reverse transcriptase in human immunodeficiency virus type 1 (HIV-1), anneals to the primer binding site (PBS) in HIV-1 RNA. It has been shown that altering the PBS and U5 regions upstream of the PBS in HIV-1 so as to be complementary to sequences in tRNA Met or tRNA His will allow these tRNA species to be stably used as primers for reverse transcription. We have examined the replication of these mutant viruses in Sup-T1 cells. When Sup-T1 cells are infected by cocultivation with HIV-1-transfected 293T cells, viruses using tRNA His or tRNA Met are produced at rates that are approximately 1/10 or 1/100, respectively, of rates for wild-type virions that use \batchmode \documentclass[fleqn,10pt,legalpaper]{article} \usepackage{amssymb} \usepackage{amsfonts} \usepackage{amsmath} \pagestyle{empty} \begin{document} \(tRNA_{3}^{Lys}\) \end{document} . When Sup-T1 cells are directly infected with equal amounts of these different viruses isolated from the culture supernatant of transfected 293T cells, virions using tRNA Met are produced at 1/100 the rate of wild-type viruses, and production of virions using tRNA His is not detected. Both wild-type and mutant virions selectively package tRNA Lys only, and examination of the ability of total viral RNA to prime reverse transcription in vitro indicates a >80% reduction in the annealing of tRNA His or tRNA Met to the mutant viral RNAs. PCR analysis of which of the three primer tRNAs is used indicates that only \batchmode \documentclass[fleqn,10pt,legalpaper]{article} \usepackage{amssymb} \usepackage{amsfonts} \usepackage{amsmath} \pagestyle{empty} \begin{document} \(tRNA_{3}^{Lys}\) \end{document} is detected as primer in wild-type virions and only tRNA His is detected as primer in virions containing a PBS complementary to tRNA His , while the mutant viruses containing a PBS complementary to tRNA Met use both tRNA Met and \batchmode \documentclass[fleqn,10pt,legalpaper]{article} \usepackage{amssymb} \usepackage{amsfonts} \usepackage{amsmath} \pagestyle{empty} \begin{document} \(tRNA_{1,2}^{Lys}\) \end{document} as primer tRNAs.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,032 | 0,021 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».