Inherited Variation in Vitamin D Genes Is Associated With Predisposition to Autoimmune Disease Type 1 Diabetes
Notice bibliographique
Résumé
OBJECTIVE: Vitamin D deficiency (25-hydroxyvitamin D [25(OH)D] <50 nmol/L) is commonly reported in both children and adults worldwide, and growing evidence indicates that vitamin D deficiency is associated with many extraskeletal chronic disorders, including the autoimmune diseases type 1 diabetes and multiple sclerosis. RESEARCH DESIGN AND METHODS: We measured 25(OH)D concentrations in 720 case and 2,610 control plasma samples and genotyped single nucleotide polymorphisms from seven vitamin D metabolism genes in 8,517 case, 10,438 control, and 1,933 family samples. We tested genetic variants influencing 25(OH)D metabolism for an association with both circulating 25(OH)D concentrations and disease status. RESULTS: Type 1 diabetic patients have lower circulating levels of 25(OH)D than similarly aged subjects from the British population. Only 4.3 and 18.6% of type 1 diabetic patients reached optimal levels (≥75 nmol/L) of 25(OH)D for bone health in the winter and summer, respectively. We replicated the associations of four vitamin D metabolism genes (GC, DHCR7, CYP2R1, and CYP24A1) with 25(OH)D in control subjects. In addition to the previously reported association between type 1 diabetes and CYP27B1 (P = 1.4 × 10(-4)), we obtained consistent evidence of type 1 diabetes being associated with DHCR7 (P = 1.2 × 10(-3)) and CYP2R1 (P = 3.0 × 10(-3)). CONCLUSIONS: Circulating levels of 25(OH)D in children and adolescents with type 1 diabetes vary seasonally and are under the same genetic control as in the general population but are much lower. Three key 25(OH)D metabolism genes show consistent evidence of association with type 1 diabetes risk, indicating a genetic etiological role for vitamin D deficiency in type 1 diabetes.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,003 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,006 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».