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Enregistrement W2155642344

Nuclear matrix proteins associated with DNA in situ in hormone-dependent and hormone-independent human breast cancer cell lines.

2000· article· en· W2155642344 sur OpenAlexaff
Virginia A. Spencer, Shanti K. Samuel, James Davie

Notice bibliographique

RevuePubMed · 2000
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueNuclear Structure and Function
Établissements canadiensUniversity of Manitoba
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésNuclear matrixBreast cancerCancer researchCarcinogenesisEstrogen receptorBiologyNuclear receptorCancerHormone receptorChromatinInternal medicineDNAMedicineTranscription factorGeneticsGene
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The nuclear matrix is a dynamic RNA-protein complex that organizes chromatin and regulates nuclear DNA metabolism. Nuclear matrix proteins informative in the diagnosis of cancer have been identified. Here, the nuclear matrix breast cancer proteins (NMBCs) cross-linked to nuclear DNA in situ with cisplatin in human breast cancer cell lines were analyzed by two-dimensional gel electrophoresis. We identified NMBCs that were differentially associated with nuclear DNA of hormone-dependent and -independent breast cancer cell lines. Three DNA cross-linked NMBCs were found to be exclusive to estrogen receptor-positive, hormone-dependent breast cancer cells, whereas two NMBCs were observed only in estrogen receptor-negative, hormone-independent breast cancer cells. Changes in these NMBCs were observed when hormone-dependent breast cancer cells became hormone independent. Furthermore, we show that the intermediate filament protein vimentin is associated with the nuclear DNA of MDA-MB-231 breast cancer cells, an estrogen receptor-negative, hormone-independent breast cancer cell line with high metastatic potential. These nuclear matrix DNA-binding proteins may play important roles in breast tumorigenesis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,196
Écart entre enseignants0,192 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations37
Publié2000
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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