Decoding ubiquitin sorting signals for clathrin-dependent endocytosis by CLASPs
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Notice bibliographique
Résumé
Cargo selectivity is a hallmark of clathrin-mediated endocytosis. A wide range of structurally unrelated internalization signals specify the preferential clustering of transmembrane cargo into clathrin coats forming on the plasma membrane. Intriguingly, the classical endocytic adaptor AP-2 appears to recognize only a subset of these endocytic sorting signals. New data now reveal the molecular basis for recognition of other internalization signals, including post-translationally appended ubiquitin, by clathrin-coat-associated sorting proteins (CLASPs). Curiously, structurally related ubiquitin-recognition modules are shared by select CLASPs and the 26S proteasome, and recent work indicates that both display similar requirements for ubiquitin binding. During endocytosis, these modules engage oligoubiquitylated cargo in the form of polyubiquitin chains and/or multiple single ubiquitin molecules appended to different acceptor lysines. Functional separation between clathrin-mediated endocytosis and proteasome-dependent proteolysis is probably ensured by temporally regulated, local assembly of ubiquitin-tagged membrane cargo at sorting stations on the cell surface, shielding ubiquitin sorting signals from the proteasome. Thus, an expanded repertoire of CLASPs couples the process of clathrin-coat assembly with high-fidelity incorporation of assorted, cargo-specific sorting signals.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,003 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
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score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle