Evolutionary analysis of subsection <i>Magnicellulatae</i> of <i>Podosphaera</i> section <i>Sphaerotheca</i> (Erysiphales) based on the rDNA internal transcribed spacer sequences with special reference to host plants
Notice bibliographique
Résumé
To understand the evolutionary history of subsection Magnicellulatae of Podosphaera section Sphaerotheca, nucleotide sequences of the rDNA internal transcribed spacer region were determined for 79 isolates from 60 host species. With the exception of two species occurring on the Scrophulariaceae, all isolates formed a large, well-defined clade. Genetic diversity among species on the Scrophulariaceae was much larger than the diversity among all other taxa, and the first split of the Magnicellulatae clade was shared by these species. This suggests that the Scrophulariaceae is the earliest host of subsection Magnicellulatae. Isolates from the Asteraceae shared the largest sequence diversity and were represented in all major groups. Most members of the basal groups consisted of isolates from the Asteraceae. This suggests that an early radiation in the large clade occurred on the Asteraceae. Based on the small sequence diversity and placement at the terminal end of the phylogenetic tree of isolates from the Cucurbitaceae and the Fabaceae, it is suggested that the ability of subsection Magnicellulatae to infect these families was acquired more recently. The groupings of fungal taxa by molecular phylogeny showed general agreement with groupings by infectivity, which suggests niche separation caused by host specialization triggers genetic divergence in these fungi.Key words: Ascomycetes, Erysiphaceae, host range, phylogeny, Podosphaera, Sphaerotheca.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».