Lactobacillus brantae sp. nov., isolated from faeces of Canada geese (Branta canadensis)
Notice bibliographique
Résumé
Three strains of lactic acid bacteria (LAB) were isolated from the faeces of apparently healthy wild Canada geese (Branta canadensis) in 2010 by cultivating faecal LAB on Rogosa SL agar under aerobic conditions. These three isolates were found to share 99.9 % gene sequence similarity of their 16S rRNA, their 16S-23S intergenic transcribed spacer region (ITS), partial 23S rRNA, rpoB, rpoC, rpoA and pheS gene sequences. However, the three strains exhibited lower levels of sequence similarity of these genetic targets to all known LAB, and the phylogenetically closest species to the geese strains were Lactobacillus casei, Lactobacillus paracasei, Lactobacillus rhamnosus and Lactobacillus saniviri. In comparison to L. casei ATCC 393(T), L. paracasei ATCC 25302(T), L. rhamnosus ATCC 7469(T) and L. saniviri DSM 24301(T), the novel isolates reacted uniquely in tests for cellobiose, galactose, mannitol, citric acid, aesculin and dextrin, and gave negative results in tests for l-proline arylamidase and l-pyrrolydonyl-arylamidase, and in the Voges-Proskauer test. Biochemical tests for cellobiose, aesculin, galactose, gentiobiose, mannitol, melezitose, ribose, salicin, sucrose, trehalose, raffinose, turanose, amygdalin and arbutin could be used for differentiation between L. saniviri and the novel strains. On the basis of phenotypic and genotypic characteristics, and phylogenetic data, the three isolates represent a novel species of the genus Lactobacillus, for which the name Lactobacillus brantae sp. nov. is proposed. The type strain is SL1108(T) (= ATCC BAA-2142(T) = LMG 26001(T) = DSM 23927(T)) and two additional strains are SL1170 and SL60106.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».