Effect of histone deacetylase inhibitors on heat shock protein gene expression during <i>Xenopus</i> development
Notice bibliographique
Résumé
We examined the effect of histone deacetylase inhibitors (HDIs), trichostatin A (TSA), valproic acid (VPA), and sodium butyrate (NaB) on heat shock protein (hsp) gene expression during early Xenopus laevis development. HDIs enhance histone acetylation and result in the relief of repressed chromatin domains and ultimately increase the accessibility of transcription factors to target cis-acting regulatory sites. Treatment of embryos with HDIs enhanced the heat shock-induced accumulation of hsp70 mRNA in post-midblastula stage embryos. No effect was observed with actin mRNA or other hsp70 family members including heat shock cognate 70 and immunoglobulin binding protein. Normally, hsp30 genes are not heat-inducible until the late neurula or early tailbud stage of development. Treatment with HDIs resulted in heat-induced expression of hsp30 genes at the gastrula stage with enhanced heat-induced accumulation in neurula and tailbud stages. HDI treatment alone did not induce the accumulation of hsp70 or hsp30 mRNA. Whole-mount in situ hybridization verified the RNA blot analyses and additionally revealed that TSA treatment did not result in any major alterations in the spatial pattern of stress-induced hsp70 or hsp30 mRNA accumulation in early embryos. This study suggests that the states of Xenopus hsp70 and 30 chromatin are subject to repression beyond the midblastula transition.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».