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Enregistrement W2155991700 · doi:10.1002/jsfa.4090

Prevalence of <i>Salmonella</i> infecting bacteriophages associated with Ontario pig farms and the holding area of a high capacity pork processing facility

2010· article· en· W2155991700 sur OpenAlexafffundabout
Sunan Wang, Weikang Zhao, Asad Raza, Robert Friendship, Roger P. Johnson, Magdalena Kostrzynska, Keith Warriner

Notice bibliographique

RevueJournal of the Science of Food and Agriculture · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueSalmonella and Campylobacter epidemiology
Établissements canadiensAgriculture and Agri-Food CanadaPublic Health Agency of CanadaUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesOntario Ministry of Agriculture, Food and Rural AffairsPublic Health Agency of CanadaUniversity of Guelph
Mots-clésSalmonellaBiologyVeterinary medicinePopulationPhage typingManureMicrobiologyBacteriaSerotypeAgronomy

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: There is interest in applying bacteriophages to control Salmonella in pig production and pork processing. The following reports on the prevalence of Salmonella infecting bacteriophages within Ontario pig farms and associated with the holding area of a pork slaughterhouse. RESULTS: Salmonella infecting bacteriophages were present in 30 and 28 of the effluent manure samples collected from 36 farms using S. Typhimurium DT104 or S. Heidelberg as host cell respectively. Bacteriophages were recovered in 95-100% of the 48 samples taken from holding pens within a high capacity slaughterhouse over a 12 month period. Bacteriophages isolated from farms exhibited similar host ranges which differed to that of slaughterhouse isolates. Salmonella (n = 21) from the slaughterhouse were susceptible to the endogenous bacteriophages. Despite being susceptible to the resident phages, the Salmonella populations were found to be genetically stable with the same genotypes being recovered over successive visits. Salmonella isolated from the farms were frequently resistant to the endogenous phages. CONCLUSIONS: Bacteriophages are prevalent in the pig slaughterhouse environment although they do not have a significant impact on the genetic structure of Salmonella populations. However, there was evidence that the Salmonella population structure on farms is influenced by the presence of infecting phages.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,476
Score d'incertitude au seuil0,957

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,187
Écart entre enseignants0,173 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations8
Publié2010
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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