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Lumican and decorin are differentially expressed in human breast carcinoma

2000· article· en· W2155991810 sur OpenAlexaff
Etienne Leygue, Linda Snell, Helmut Dotzlaw, Sandra Troup, Tamara Hiller-Hitchcock, Leigh C. Murphy, Peter J. Roughley, Peter H. Watson

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Pathology · 2000
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueProteoglycans and glycosaminoglycans research
Établissements canadiensShriners Hospitals for Children - CanadaUniversity of Manitoba
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésLumicanDecorinProteoglycanBiglycanBiologyStromaBreast cancerBreast carcinomaMolecular biologyPathologyImmunohistochemistryCancerExtracellular matrixCell biologyMedicineImmunologyGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Previous studies have shown that lumican is expressed and increased in the stroma of breast tumours. Lumican expression has now been examined relative to other members of the small leucine-rich proteoglycan gene family in normal and neoplastic breast tissues, to begin to determine its role in breast tumour progression. Western blot study showed that lumican protein is highly abundant relative to decorin, while biglycan and fibromodulin are only detected occasionally in breast tissues (n=15 cases). Further analysis of lumican and decorin expression performed in matched normal and tumour tissues by in situ hybridization showed that both mRNAs were expressed by similar fibroblast-like cells adjacent to epithelium. However, lumican mRNA expression was significantly increased in tumours (n=34, p<0.0001), while decorin mRNA was decreased (p=0.0002) in neoplastic relative to adjacent normal stroma. This was accompanied by a significant increase in lumican protein (n=12, p=0.0122), but not decorin. Further evidence of altered lumican expression in breast cancer was manifested by discordance between lumican mRNA and protein localization in some regions of tumours but not in adjacent morphologically normal tissues. It is concluded that lumican is the most abundant of these proteoglycans in breast tumours and that lumican and decorin are inversely regulated in association with breast tumourigenesis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,260
Écart entre enseignants0,250 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations136
Publié2000
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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