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Enregistrement W2156142245 · doi:10.1038/ismej.2011.163

Microbes in thawing permafrost: the unknown variable in the climate change equation

2011· article· en· W2156142245 sur OpenAlexafffund
David E. Graham, Matthew D. Wallenstein, Tatiana A. Vishnivetskaya, Mark P. Waldrop, Tommy J. Phelps, Susan M. Pfiffner, T. C. Onstott, Lyle G. Whyte, Elizaveta Rivkina, D. Gilichinsky, Dwayne A. Elias, Rachel Mackelprang, Nathan C. VerBerkmoes, Robert L. Hettich, Dirk Wagner, Stan D. Wullschleger, Janet Jansson

Notice bibliographique

RevueThe ISME Journal · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineEarth and Planetary Sciences
ThématiqueClimate change and permafrost
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesLawrence Berkeley National LaboratoryOak Ridge National LaboratoryBiological and Environmental ResearchOffice of ScienceU.S. Department of EnergyEarth Sciences DivisionJoint Genome InstituteRussian Academy of SciencesUniversity of Tennessee, KnoxvilleMcGill UniversityPrinceton UniversityBattelle
Mots-clésBiologyPermafrostClimate changeVariable (mathematics)EcologyAtmospheric sciencesComputational biologyMathematicsMathematical analysis

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Considering that 25% of Earth's terrestrial surface is underlain by permafrost (ground that has been continuously frozen for at least 2 years), our understanding of the diversity of microbial life in this extreme habitat is surprisingly limited. Taking into account the total mass of perennially frozen sediment (up to several hundred meters deep), permafrost contains a huge amount of buried, ancient organic carbon ( Tarnocai et al., 2009 ). In addition, permafrost is warming rapidly in response to global climate change ( Romanovsky et al., 2010 ), potentially leading to widespread thaw and a larger, seasonally thawed soil active layer. This concern has prompted the question: will permafrost thawing lead to the release of massive amounts of carbon dioxide (CO 2 ) and methane (CH 4 ) into the atmosphere? This question can only be answered by understanding how the microbes residing in permafrost will respond to thaw, through processes such as respiration, fermentation, methanogenesis and CH 4 oxidation ( Schuur et al., 2009 ).

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,004
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,031
Score d'incertitude au seuil0,062

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,004
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,002
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0020,004
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0070,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,147
Tête enseignante GPT0,250
Écart entre enseignants0,103 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations167
Publié2011
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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