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Enregistrement W2156169240 · doi:10.1186/s13058-015-0529-8

In silico discovery and validation of potent small-molecule inhibitors targeting the activation function 2 site of human oestrogen receptor α

2015· article· en· W2156169240 sur OpenAlexafffund
Kriti Singh, Ravi S. N. Munuganti, Eric Leblanc, Yu Lun Lin, Euphemia Leung, Nada Lallous, Miriam Butler, Artem Cherkasov, Paul S. Rennie

Notice bibliographique

RevueBreast Cancer Research · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEstrogen and related hormone effects
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesFaculty of Medical and Health Sciences, University of AucklandCanadian Cancer Society Research Institute
Mots-clésCoactivatorIn silicoHeLaEstrogen receptor alphaCancer researchSmall moleculeEstrogen receptorBiologyChemistryMolecular biologyIn vitroTranscription factorBiochemistryCancerGeneBreast cancerGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

INTRODUCTION: Current approaches to inhibit oestrogen receptor-alpha (ERα) are focused on targeting its hormone-binding pocket and have limitations. Thus, we propose that inhibitors that bind to a coactivator-binding pocket on ERα, called activation function 2 (AF2), might overcome some of these limitations. METHODS: In silico virtual screening was used to identify small-molecule ERα AF2 inhibitors. These compounds were screened for inhibition of ERα transcriptional activity using stably transfected T47D-KBluc cell line. A direct physical interaction between the AF2 binders and the ERα protein was measured using biolayer interferometry (BLI) and an ERα coactivator displacement assay. Cell viability was assessed by MTS assay in ERα-positive MCF7 cells, tamoxifen-resistant (TamR) cell lines TamR3 and TamR6, and ERα-negative MDA-MB-453 and HeLa cell lines. In addition, ERα inhibition in TamR cells and the effect of compounds on mRNA and protein expression of oestrogen-dependent genes, pS2, cathepsin D and cell division cycle 2 (CDC2) were determined. RESULTS: Fifteen inhibitors from two chemical classes, derivatives of pyrazolidine-3,5-dione and carbohydrazide, were identified. In a series of in vitro assays, VPC-16230 of the carbohydrazide chemical class emerged as a lead ERα AF2 inhibitor that significantly downregulated ERα transcriptional activity (half-maximal inhibitory concentration = 5.81 μM). By directly binding to the ERα protein, as confirmed by BLI, VPC-16230 effectively displaced coactivator peptides from the AF2 pocket, confirming its site-specific action. VPC-16230 selectively suppressed the growth of ERα-positive breast cancer cells. Furthermore, it significantly inhibited ERα mediated transcription in TamR cells. More importantly, it reduced mRNA and protein levels of pS2, cathepsin D and CDC2, validating its ER-directed activity. CONCLUSION: We identified VPC-16230 as an ERα AF2-specific inhibitor that demonstrated promising antiproliferative effects in breast cancer cell lines, including TamR cells. VPC-16230 reduced the expression of ERα-inducible genes, including CDC2, which is involved in cell division. We anticipate that the application of ERα AF2 inhibitors will provide a novel approach that can act as a complementary therapeutic to treat ERα-positive, tamoxifen-resistant and metastatic breast cancers.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,012
Score d'incertitude au seuil0,214

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,025
Tête enseignante GPT0,315
Écart entre enseignants0,290 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations24
Publié2015
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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