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Enregistrement W2156189676 · doi:10.1093/pcp/pcs103

PLEIOTROPIC REGULATORY LOCUS 2 exhibits unequal genetic redundancy with its homolog PRL1

2012· article· en· W2156189676 sur OpenAlexafffund
Tabea Weihmann, Kristoffer Palma, Yukino Nitta, Xin Li

Notice bibliographique

RevuePlant and Cell Physiology · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant-Microbe Interactions and Immunity
Établissements canadiensCanada's Michael Smith Genome Sciences CentreUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaDirectorate for Biological Sciences
Mots-clésLocus (genetics)MutantGeneBiologyGeneticsPhenotypeAlleleSuppressorFunction (biology)Protein functionCell biology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

In plants, signaling leading to resistance against biotrophic pathogens is complex. Perception of pathogenic microbes by resistance (R) proteins is relayed though successive activities of downstream components, in a network that is not well understood. PLEIOTROPIC REGULATORY LOCUS 1 (PRL1) and >20 other proteins are members of the MOS4-associated complex (MAC), a regulatory node in defense signaling. Of all characterized MAC members, mutations in PRL1 cause the most severe susceptibility towards both virulent and avirulent microbial pathogens. Genetic suppressors of prl1 represent new signaling elements and may aid in further unraveling of defense mechanisms. Our identification and characterization of a dominant suppressor of prl1 revealed a regulatory, gain-of-function mutation in PLEIOTROPIC REGULATORY LOCUS 2 (PRL2), a close homolog of PRL1. Loss-of-function mutants of PRL2 do not exhibit altered phenotypes; however, prl1 prl2 double mutants exhibit enhanced morphological defects consistent with unequal genetic redundancy between the homologs. Up-regulated gene expression mediated by the dominant prl2-1D allele completely suppresses disease susceptibility in the prl1 mutant background and also restores wild-type appearance, further supporting functional equivalence between the two PRL proteins.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,183
Écart entre enseignants0,170 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations10
Publié2012
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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