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Enregistrement W2156244763 · doi:10.1093/hmg/ddr226

Common alleles at 6q25.1 and 1p11.2 are associated with breast cancer risk for BRCA1 and BRCA2 mutation carriers

2011· article· en· W2156244763 sur OpenAlexafffund
Antonis C. Antoniou, Christiana Kartsonaki, Olga M. Sinilnikova, Penny Soucy, Lesley McGuffog, Sue Healey, Andrew Lee, Paolo Peterlongo, Siranoush Manoukian, Bernard Peissel, Daniela Zaffaroni, Elisa Cattaneo, Monica Barile, Valeria Pensotti, Barbara Pasini, Riccardo Dolcetti, Giuseppe Giannini, Anna Laura Putignano, Liliana Varesco, Paolo Radice, Mark H. Greene, Irene L. Andrulis, Gord Glendon, Hilmi Özçelik, Mads Thomassen, Anne‐Marie Gerdes, Torben A. Kruse, Uffe Birk Jensen, Dorthe Gylling Crüger, Maria A. Caligo, Yael Laitman, Roni Milgrom, Bella Kaufman, Shani Paluch–Shimon, Eitan Friedman, Niklas Loman, Katja Harbst, Annika Lindblom, Brita Arver, Hans Ehrencrona, Beatrice Melin, Katherine L. Nathanson, Susan M. Domchek, Timothy R. Rebbeck, Anna Jakubowska, Jan Lubiński, Jacek Gronwald, Tomasz Huzarski, Tomasz Byrski, Cezary Cybulski, Bohdan Górski, Ana Osório, Teresa Ramón y Cajal, Florentia Fostira, Raquel Andrés, Javier Benı́tez, Ute Hamann, Frans B.L. Hogervorst, Matti A. Rookus, Maartje J. Hooning, Marcel Nelen, Rob B. van der Luijt, Theo A.M. van Os, Christi J. van Asperen, Peter Devilee, Hanne Meijers‐Heijboer, E. Gómez, Susan Peock, Margaret Cook, Debra Frost, Radka Platte, Jean Leyland, D. Gareth Evans, Fiona Lalloo, Rosalind A. Eeles, Louise Izatt, Julian Adlard, Rosemarie Davidson, Diana Eccles, Kai-Ren Ong, Jackie Cook, Fiona Douglas, Joan Paterson, Michael J. Kennedy, Zosia Miedzybrodzka, Andrew K. Godwin, Dominique Stoppa‐Lyonnet, Bruno Buecher, Muriel Belotti, Carole Tirapo, Sylvie Mazoyer, Laure Barjhoux, Christine Lasset, Dominique Leroux, Laurence Faivre, Myriam Bronner, Fabienne Prieur, Catherine Noguès, Étienne Rouleau, Pascal Pujol, Isabelle Coupier, Marc Frénay, John L. Hopper, Mary B. Daly, Mary Beth Terry, Esther M. John, Saundra S. Buys, Yosuf Yassin, Alexander Miron, David E. Goldgar, Christian F. Singer, Muy‐Kheng Tea, Georg Pfeiler, Anne Catharina Dressler, Thomas van Overeem Hansen, Lars Jønson, Bent Ejlertsen, Rósa B. Barkardóttir, Tomas Kirchhoff, Kenneth Offit, Marion Piedmonte, Gustavo C. Rodriguez, Laurie Small, John F. Boggess, Stephanie V. Blank, Jack Basil, Masoud Azodi, Amanda E. Toland, Marco Montagna, Silvia Tognazzo, Simona Agata, Evgeny Imyanitov, Ramūnas Janavičius, Conxi Lázaro, Ignacio Blanco, Paul D.P. Pharoah, Lara Sucheston, Beth Y. Karlan, Christine Walsh, Edith Oláh, Anikó Bozsik, Soo‐Hwang Teo, Joyce Seldon, Mary Beattie, Elizabeth J. van Rensburg, Michelle D. Sluiter, Orland Dı́ez, Rita K. Schmutzler, Barbara Wappenschmidt, Christoph Engel, Alfons Meindl, I. Ruehl, Raymonda Varon-Mateeva, Karin Kast, Helmut Deißler, Dieter Niederacher, Norbert Arnold, Dorothea Gadzicki, Ines Schönbuchner, Miguel de la Hoya, Heli Nevanlinna, Kristiina Aittomäki, Martine Dumont, Jocelyne Chiquette, Marc Tischkowitz, Jonathan Beesley, Amanda B. Spurdle, Susan L. Neuhausen, Yuan Chun Ding, Zachary Fredericksen, Xianshu Wang, V. Shane Pankratz, Fergus J. Couch, Jacques Simard, Douglas F. Easton, Georgia Chenevix‐Trench

Notice bibliographique

RevueHuman Molecular Genetics · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBRCA gene mutations in cancer
Établissements canadiensUniversité LavalMcGill UniversityJewish General HospitalUniversity of TorontoCentre hospitalier universitaire de QuébecMount Sinai HospitalLunenfeld-Tanenbaum Research InstituteCancer Care Ontario
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchNational Institutes of HealthNational Cancer InstituteNational Institute for Health and Care ResearchCancer Research UK
Mots-clésBiologyAlleleGeneticsBreast cancerMutationBRCA2 ProteinCancer researchCancerGermline mutationGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Two single nucleotide polymorphisms (SNPs) at 6q25.1, near the ESR1 gene, have been implicated in the susceptibility to breast cancer for Asian (rs2046210) and European women (rs9397435). A genome-wide association study in Europeans identified two further breast cancer susceptibility variants: rs11249433 at 1p11.2 and rs999737 in RAD51L1 at 14q24.1. Although previously identified breast cancer susceptibility variants have been shown to be associated with breast cancer risk for BRCA1 and BRCA2 mutation carriers, the involvement of these SNPs to breast cancer susceptibility in mutation carriers is currently unknown. To address this, we genotyped these SNPs in BRCA1 and BRCA2 mutation carriers from 42 studies from the Consortium of Investigators of Modifiers of BRCA1/2. In the analysis of 14 123 BRCA1 and 8053 BRCA2 mutation carriers of European ancestry, the 6q25.1 SNPs (r(2) = 0.14) were independently associated with the risk of breast cancer for BRCA1 mutation carriers [hazard ratio (HR) = 1.17, 95% confidence interval (CI): 1.11-1.23, P-trend = 4.5 × 10(-9) for rs2046210; HR = 1.28, 95% CI: 1.18-1.40, P-trend = 1.3 × 10(-8) for rs9397435], but only rs9397435 was associated with the risk for BRCA2 carriers (HR = 1.14, 95% CI: 1.01-1.28, P-trend = 0.031). SNP rs11249433 (1p11.2) was associated with the risk of breast cancer for BRCA2 mutation carriers (HR = 1.09, 95% CI: 1.02-1.17, P-trend = 0.015), but was not associated with breast cancer risk for BRCA1 mutation carriers (HR = 0.97, 95% CI: 0.92-1.02, P-trend = 0.20). SNP rs999737 (RAD51L1) was not associated with breast cancer risk for either BRCA1 or BRCA2 mutation carriers (P-trend = 0.27 and 0.30, respectively). The identification of SNPs at 6q25.1 associated with breast cancer risk for BRCA1 mutation carriers will lead to a better understanding of the biology of tumour development in these women.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,347
Score d'incertitude au seuil0,962

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,257
Écart entre enseignants0,242 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations77
Publié2011
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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