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Enregistrement W2156267687 · doi:10.1074/jbc.m412676200

Transcriptional Activity of the Paired-like Homeodomain Proteins CHX10 and VSX1

2005· article· en· W2156267687 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2005
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRetinal Development and Disorders
Établissements canadiensUniversity of TorontoUniversity Health Network
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésRepressorHomeoboxBiologyTranscription factorEnhancerGeneMolecular biologyCell biologyGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

CHX10 and VSX1 are homeodomain (HD) proteins essential for normal retinal development. CHX10 is required first for retinal progenitor cell proliferation and later for bipolar cell differentiation, whereas VSX1 is important in the terminal differentiation of a subset of bipolar cells. Elucidating the transcriptional activity of CHX10 and VSX1 is required to understand how these factors control retinal development. We show that CHX10 and Vsx1 can function as transcriptional repressors. When tethered to a promoter by a heterologous LexA DNA-binding domain or its HD, CHX10 repressed multiple classes of activators in different immortalized cell lines. CHX10 blocked TATA-containing and TATA-less promoters, repressed at a distance, and inhibited a complex enhancer positioned upstream or downstream of the reporter gene, whereas retinoblastoma protein (RB) inhibited the downstream enhancer only. Interestingly, CHX10 mildly potentiated a subset of activators in chick neuronal cultures. Thus, CHX10 is both a versatile repressor and a context-specific weak activator. The CHX10 HD and CVC domains were sufficient for DNA binding and repression. VSX1 contains closely related homeo and CVC domains and, like CHX10, also repressed transcription. A VSX1 HD mutation, R166W, that impairs DNA binding and causes keratoconus in humans, hindered repressor function. Therefore, CHX10 and VSX1 may control retinal bipolar cell specification or differentiation by repressing genes required for the development of other cell types.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,090
Score d'incertitude au seuil0,240

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,220
Écart entre enseignants0,207 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle