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Enregistrement W2156311451 · doi:10.1071/fp03195

The Tic40 translocon components exhibit preferential interactions with different forms of the Oee1 plastid protein precursor

2004· article· en· W2156311451 sur OpenAlexaff
Kenton Ko, Susitna Banerjee, Jennette Innes, Darcie Taylor, Zdenka Ko

Notice bibliographique

RevueFunctional Plant Biology · 2004
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePhotosynthetic Processes and Mechanisms
Établissements canadiensQueen's University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPlastidBiologyTransloconThylakoidCell biologyChaperone (clinical)Transport proteinBiochemistryComputational biologyGeneChloroplastChromosomal translocation

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The transport of proteins across the plastid envelope involves a host of proteinaceous components that attend to varying structural needs of the process. This study focuses on interactions between two select forms (designated Tic40 and Toc36) of the Tic40-related components and different structural versions of the Oee1 precursor to dissect the components' mode of operation. Interaction profiling revealed several features pertaining to how Tic40-related components might work during the transport process. The main operational features revealed are: (1) Tic40 interacts preferentially with Oee1 precursors containing only the plastid-targeting domain, (2) Toc36 interacts preferentially with Oee1 precursors containing both plastid- and thylakoid lumen-targeting domains, (3)carboxyl truncations to either the entire Oee1 precursor or Toc36 affect interactions negatively, and (4) the general reduction of Tic40-related protein levels in transgenic plants appears to exert a greater negative impact on endogenous Oee1 levels than the other proteins assessed, a trend that corroborates the findings of the protein interaction experiments.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,204
Écart entre enseignants0,192 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations8
Publié2004
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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