A polyketide synthase of <i>Plumbago indica</i> that catalyzes the formation of hexaketide pyrones
Notice bibliographique
Résumé
Plumbago indica L. contains naphthoquinones that are derived from six acetate units. To characterize the enzyme catalyzing the first step in the biosynthesis of these metabolites, a cDNA encoding a type III polyketide synthase (PKS) was isolated from roots of P. indica. The translated polypeptide shared 47-60% identical residues with PKSs from other plant species. Recombinant P. indica PKS expressed in Escherichia coli accepted acetyl-CoA as starter and carried out five decarboxylative condensations with malonyl coenzyme A (-CoA). The resulting hexaketide was not folded into a naphthalene derivative. Instead, an alpha-pyrone, 6-(2',4'-dihydroxy-6'-methylphenyl)-4-hydroxy-2-pyrone, was produced. In addition, formation of alpha-pyrones with linear keto side chains derived from three to six acetate units was observed. As phenylpyrones could not be detected in P. indica roots, we propose that the novel PKS is involved in the biosynthesis of naphthoquinones, and additional cofactors are probably required for the biosynthesis of these secondary metabolites in vivo.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».