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Enregistrement W2156350288 · doi:10.1046/j.1365-2958.2003.03638.x

Regulation of tryptophan synthase gene expression in <i>Chlamydia trachomatis</i>

2003· article· en· W2156350288 sur OpenAlexaff
Heidi Wood, Christine Fehlner‐Gardner, Jody Berry, Elizabeth R. Fischer, Bonnie A. Graham, Ted Hackstadt, Christine Roshick, Grant McClarty

Notice bibliographique

RevueMolecular Microbiology · 2003
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueReproductive tract infections research
Établissements canadiensUniversity of ManitobaCanadian Science Centre for Human and Animal HealthCanadian Food Inspection AgencyManitoba Health
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésTryptophan synthaseTryptophanBiologytrp operonGeneChlamydia trachomatisChlamydiaeIndole testBiochemistryGene expressionIntracellularCycloheximideMolecular biologyAmino acidProtein biosynthesislac operonVirology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

We previously reported that Chlamydia trachomatis expresses the genes encoding tryptophan synthase (trpA and trpB). The results presented here indicate that C. trachomatis also expresses the tryptophan repressor gene (trpR). The complement of genes regulated by tryptophan levels in C. trachomatis is limited to trpBA and trpR. trp gene expression was repressed if chlamydiae-infected HeLa cells were cultured the presence of tryptophan and induced if grown in tryptophan-depleted medium or in the presence of IFN-gamma. Furthermore, expression of the trp genes in strains which encode a functional tryptophan synthase is repressed when infected cells are cultured in the presence of the tryptophan precursor indole. Results from experiments with cycloheximide, an inhibitor of eukaryotic protein synthesis, indicate that in addition to the absolute size of the intracellular tryptophan pool, host competition for available tryptophan plays a key role in regulating expression of the trp genes. The tryptophan analogue, 5-fluorotryptophan, repressed trp gene expression and induced the formation of aberrant organisms of C. trachomatis. The growth-inhibitory properties of 5-fluorotryptophan could be reversed with exogenous tryptophan but not indole. In total, our results indicate that the ability to regulate trp gene expression in response to tryptophan availability is advantageous for the intracellular survival of this organism. Furthermore, the fact that C. trachomatis has retained the capacity to respond to tryptophan limitation supports the view that the in vivo antichlamydial effect of IFN-gamma is via the induction of the tryptophan-degrading enzyme, indoleamine 2,3-dioxygenase.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,013
Score d'incertitude au seuil0,782

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,250
Écart entre enseignants0,241 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations67
Publié2003
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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