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Enregistrement W2156372522 · doi:10.1128/jb.00910-07

The Amino Terminus of <i>Bacillus subtilis</i> TagB Possesses Separable Localization and Functional Properties

2007· article· en· W2156372522 sur OpenAlexafffund
Amit P. Bhavsar, Michael A. D’Elia, Tiffany D. Sahakian, Eric D. Brown

Notice bibliographique

RevueJournal of Bacteriology · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBacterial Genetics and Biotechnology
Établissements canadiensMcMaster University
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchCanada Research Chairs
Mots-clésBacillus subtilisBiologyBacterial proteinComputational biologyBiochemistryMicrobiologyCell biologyGeneticsBacteria

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The function(s) of gram-positive wall teichoic acid is emerging with recent findings that it is an important virulence factor in the pathogen Staphylococcus aureus and that it is crucial to proper rod-shaped cell morphology of Bacillus subtilis. Despite its importance, our understanding of teichoic acid biosynthesis remains incomplete. The TagB protein has been implicated in the priming step of poly(glycerol phosphate) wall teichoic acid synthesis in B. subtilis. Work to date indicates that the TagB protein is localized to the membrane, where it adds a single glycerol phosphate residue to the nonreducing end of the undecaprenol-phosphate-linked N-acetylmannosamine-beta(1,4)-N-acetylglucosamine-1-phosphate. Thus, membrane association is critical to TagB function. In this work we elucidate the mechanism of TagB membrane localization. We report the identification of a membrane targeting determinant at the amino terminus of TagB that is necessary and sufficient for membrane localization. The putative amphipathicity of this membrane targeting determinant was characterized and shown to be required for TagB function but not localization. This work shows for the first time that the amino terminus of TagB mediates membrane targeting and protein function.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,217
Écart entre enseignants0,207 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations16
Publié2007
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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