Ensembl BioMarts: a hub for data retrieval across taxonomic space
Pourquoi ce travail est-il dans la base ?
Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.
Aucune affiliation canadienne. Une base fondée sur la seule affiliation (le devis habituel) n'aurait jamais vu ce travail. C'est l'un des travaux qui justifient l'inversion de la base.
Résumé
For a number of years the BioMart data warehousing system has proven to be a valuable resource for scientists seeking a fast and versatile means of accessing the growing volume of genomic data provided by the Ensembl project. The launch of the Ensembl Genomes project in 2009 complemented the Ensembl project by utilizing the same visualization, interactive and programming tools to provide users with a means for accessing genome data from a further five domains: protists, bacteria, metazoa, plants and fungi. The Ensembl and Ensembl Genomes BioMarts provide a point of access to the high-quality gene annotation, variation data, functional and regulatory annotation and evolutionary relationships from genomes spanning the taxonomic space. This article aims to give a comprehensive overview of the Ensembl and Ensembl Genomes BioMarts as well as some useful examples and a description of current data content and future objectives. Database URLs: http://www.ensembl.org/biomart/martview/; http://metazoa.ensembl.org/biomart/martview/; http://plants.ensembl.org/biomart/martview/; http://protists.ensembl.org/biomart/martview/; http://fungi.ensembl.org/biomart/martview/; http://bacteria.ensembl.org/biomart/martview/.
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La notice
- Revue
- Database
- Thématique
- Genomics and Phylogenetic Studies
- Domaine
- Biochemistry, Genetics and Molecular Biology
- Établissements canadiens
- —
- Organismes subventionnaires
- Biotechnology and Biological Sciences Research CouncilBill and Melinda Gates FoundationEuropean CommissionDirectorate for Biological SciencesOntario Institute for Cancer ResearchWellcome Trust
- Mots-clés
- EnsemblComputer scienceGenomeWorld Wide WebAnnotationData scienceBiologyGenomicsArtificial intelligenceGeneGenetics
- Résumé présent dans OpenAlex
- oui