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Enregistrement W2156610323 · doi:10.1158/1055-9965.epi-05-0073

Correlation of Human Papillomavirus Type 16 and Human Papillomavirus Type 18 E7 Messenger RNA Levels with Degree of Cervical Dysplasia

2005· article· en· W2156610323 sur OpenAlexaff
Michael E. Scheurer, Guillermo Tortolero‐Luna, Martial Guillaud, Michele Follen, Zhuo Chen, Laura M. Dillon, Karen Adler‐Storthz

Notice bibliographique

RevueCancer Epidemiology Biomarkers & Prevention · 2005
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCervical Cancer and HPV Research
Établissements canadiensBC Cancer Agency
Organismes subventionnairesNational Cancer Institute
Mots-clésDysplasiaCervical cancerMalignant transformationCervical intraepithelial neoplasiaMessenger RNAHuman papillomavirusHPV infectionBiologyGeneCancer researchIntraepithelial neoplasiaReal-time polymerase chain reactionCancerOncologyInternal medicineVirologyMedicineGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Infection with certain types of human papillomavirus (HPV) is a necessary event in the development of cervical carcinoma; however, not all women who become infected with HPV will progress to cancer. Much is known about the molecular influence of HPV E6 and E7 proteins on the malignant transformation. Little is known about the additional factors needed to drive the process. Quantitative real-time PCR was used to quantitate mRNA expression of the E7 gene in women exhibiting normal epithelium, low-grade squamous intraepithelial lesions (LSIL), and high-grade squamous intraepithelial lesions (HSIL). Prevalence of mRNA transcripts was lower among normal women (27%) than for women with LSIL (40%) and HSIL (37%). Mean levels ranged from 2.0 (ln scale per 20 ng cDNA) among normal women to 4.2 among those with HSIL, with a significant trend (P=0.008). This trend was only significant for HPV 18 transcripts if separately analyzed by HPV type. The transcriptional activity of HPV 18 is higher than that of HPV 16 and increases with increasing level of dysplasia. This is in concert with the findings of other studies, and reinforces the notion that HPV 18 is a more aggressive viral type. Real-time PCR of viral transcripts could provide a more efficient method to analyze the oncogenic potential within cells from a cervical swab, thus providing a way to better screen women who may progress to higher grade lesions or invasive carcinoma from those who will spontaneously regress.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,151
Tête enseignante GPT0,430
Écart entre enseignants0,279 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations26
Publié2005
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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