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Enregistrement W2156613944 · doi:10.1534/genetics.109.110130

Mating-System Variation, Demographic History and Patterns of Nucleotide Diversity in the Tristylous Plant <i>Eichhornia paniculata</i>

2009· article· en· W2156613944 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueGenetics · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic diversity and population structure
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésSelfingBiologyOutcrossingCoalescent theoryMating systemNucleotide diversityPopulationInbreedingDemographic historyGenetic diversityLinkage disequilibriumGenetic variationEffective population sizeEvolutionary biologyInbreeding depressionEcologyMatingGeneticsAllelePollenHaplotypePhylogenetic treeDemography

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Inbreeding in highly selfing populations reduces effective size and, combined with demographic conditions associated with selfing, this can erode genetic diversity and increase population differentiation. Here we investigate the role that variation in mating patterns and demographic history play in shaping the distribution of nucleotide variation within and among populations of the annual neotropical colonizing plant Eichhornia paniculata, a species with wide variation in selfing rates. We sequenced 10 EST-derived nuclear loci in 225 individuals from 25 populations sampled from much of the geographic range and used coalescent simulations to investigate demographic history. Highly selfing populations exhibited moderate reductions in diversity but there was no significant difference in variation between outcrossing and mixed mating populations. Population size interacted strongly with mating system and explained more of the variation in diversity within populations. Bayesian structure analysis revealed strong regional clustering and selfing populations were highly differentiated on the basis of an analysis of F(st). There was no evidence for a significant loss of within-locus linkage disequilibrium within populations, but regional samples revealed greater breakdown in Brazil than in selfing populations from the Caribbean. Coalescent simulations indicate a moderate bottleneck associated with colonization of the Caribbean from Brazil approximately 125,000 years before the present. Our results suggest that the recent multiple origins of selfing in E. paniculata from diverse outcrossing populations result in higher diversity than expected under long-term equilibrium.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,051
Score d'incertitude au seuil0,356

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,189
Écart entre enseignants0,177 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle