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Enregistrement W2156650882 · doi:10.1002/ajmg.b.30696

Initial association of <i>NR2E1</i> with bipolar disorder and identification of candidate mutations in bipolar disorder, schizophrenia, and aggression through resequencing

2008· article· en· W2156650882 sur OpenAlexafffund
Ravinesh A. Kumar, Kevin A. McGhee, Stephen Leach, Russell J. Bonaguro, Alan Maclean, Rosalía Aguirre-Hernández, Brett S. Abrahams, Emil F. Coccaro, Sheilagh Hodgins, Gustavo Turecki, Anne Condon, Walter Muir, Angela Brooks‐Wilson, Douglas Blackwood, Elizabeth M. Simpson

Notice bibliographique

RevueAmerican Journal of Medical Genetics Part B Neuropsychiatric Genetics · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetics and Neurodevelopmental Disorders
Établissements canadiensCanada's Michael Smith Genome Sciences CentreChild and Family Research InstituteDouglas Mental Health University InstituteUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesWellcome TrustChild and Family Research Institute
Mots-clésBipolar disorderCandidate geneSchizophrenia (object-oriented programming)PsychologyGenetic associationGeneticsNeurosciencePsychiatryBiologySingle-nucleotide polymorphismGenotypeGeneCognition

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Nuclear receptor 2E1 gene (NR2E1) resides within a 6q21-22 locus for bipolar disorder and schizophrenia. Mice deleted for Nr2e1 show altered neurogenesis, cortical and limbic abnormalities, aggression, hyperexcitability, and cognitive impairment. NR2E1 is therefore a positional and functional candidate for involvement in mental illness. We performed association analyses in 394 patients with bipolar disorder, 396 with schizophrenia, and 479 controls using six common markers and haplotypes. We also performed a comprehensive mutation screen of NR2E1, resequencing its entire coding region, complete 5' and 3' untranslated regions, consensus splice-sites, and evolutionarily conserved regions in 126 humans with bipolar disorder, schizophrenia, or aggressive disorders. NR2E1 was associated with bipolar disorder I and II [odds ratio (OR = 0.77, P = 0.013), bipolar disorder I (OR = 0.77, P = 0.015), bipolar disorder in females (OR = 0.72, P = 0.009), and with age at onset < or = 25 years (OR = 0.67, P = 0.006)], all of which remained significant after correcting for multiple comparisons. We identified eight novel candidate mutations that were absent in 325 controls; four of these were predicted to alter known neural transcription factor binding sites. Analyses of NR2E1 mRNA in human brain revealed forebrain-specific transcription. The data presented support the hypothesis that genetic variation at NR2E1 may be associated with susceptibility to brain-behavior disorders.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,092
Score d'incertitude au seuil0,742

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,257
Écart entre enseignants0,249 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations47
Publié2008
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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