MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2156698513 · doi:10.1128/jcm.02062-06

Testing the Interaction between NOD-2 Status and Serological Response to<i>Mycobacterium paratuberculosis</i>in Cases of Inflammatory Bowel Disease

2007· article· en· W2156698513 sur OpenAlexaffabout
Çharles N. Bernstein, Ming‐Hsi Wang, Michael Sargent, Steven R. Brant, Michael T. Collins

Notice bibliographique

RevueJournal of Clinical Microbiology · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueMycobacterium research and diagnosis
Établissements canadiensUniversity of Manitoba
Organismes subventionnairesNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney DiseasesNational Institutes of Health
Mots-clésSerologyParatuberculosisNodImmunologyPopulationBiologyVirologyAntibodyMedicineMycobacteriumGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

In a population-based case-control study we have previously shown that 14% of healthy Manitobans carry one or two mutations in the NOD-2 locus, a gene highly associated with Crohn's disease (CD). The NOD-2 protein is the receptor responsible for recognition of bacterial peptidoglycans, and it is plausible that NOD-2 is involved in the recognition of mycobacteria. Thirty-seven percent of Manitobans with CD had >or=1 NOD-2 mutation, leading to a threefold increased risk of CD for single-mutant carriers and a 30-fold increased risk for double-mutant carriers. In the same population groups, we assessed the seroprevalence for Mycobacterium paratuberculosis and found it to be 35%, with no differences between CD, ulcerative colitis (UC), and controls. Because of high rates of CD and UC in Manitoba, we assessed whether there was an interaction between carrying a NOD-2 mutation and M. paratuberculosis seropositivity. An enzyme-linked immunosorbent assay for serum antibodies to M. paratuberculosis in cattle was adapted for human use. DNA was purified from whole blood. Subjects were genotyped for three NOD-2 variants, G908R, Cins1007fs, and R702W. Multivariate logistic regression analysis showed that NOD-2 gene mutations significantly associated with CD, but M. paratuberculosis serology did not. Furthermore, there was no interaction between NOD-2 mutation status and M. paratuberculosis serology status. For those with the NOD-2 mutation, the likelihood of CD subjects having positive M. paratuberculosis serology was similar to that of controls (odds ratio, 1.31; 95% confidence interval, 0.55-3.11). No interaction could be proven for UC or by combining CD and UC compared to controls. In conclusion, we could not find an interaction between the NOD-2 genotype and M. paratuberculosis serology in relationship to CD or UC.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,006
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,024
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,147
Score d'incertitude au seuil0,984

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0060,024
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,080
Tête enseignante GPT0,406
Écart entre enseignants0,326 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations34
Publié2007
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueJournal of Clinical MicrobiologyMême sujetMycobacterium research and diagnosisTravaux en français237 207